实测上新 | 吉因加时空转录组FFPE V1.1实测数据秀出硬实力

2025.11.04 内容来源:华大时空

今年9月,升级版的华大时空转录组FFPE V1.1正式发布。该产品方案通过基因捕获效率提升、组织内外信号扩散优化、数据利用率提升及多样本混测兼容性四大核心创新,解决了长期困扰FFPE样本研究的RNA降解、空间信息失真等瓶颈问题,为肿瘤病理研究、感染性疾病机制研究及神经科学探索提供了更强大的工具支持。

华大时空组学生态合作伙伴吉因加已完成时空转录组FFPE V1.1测试,快来看看数据有哪些亮眼之处吧。

/吉因加实测数据/

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/时空转录组FFPE V1.1直击临床研究挑战/

1. 基因捕获效率提升100%,破解FFPE样本“沉默黑匣”

传统技术对FFPE样本的RNA捕获效率较低,时空转录组FFPE V1.1通过优化探针设计及生化反应效率等方法,在保持编码&非编码RNA捕获,微生物捕获等性能的基础上,基因捕获效率相比上一版本提升50%-200%。

2. 组织内外信号扩散优化,空间定位精度达纳米级

针对FFPE样本中RNA扩散导致的空间定位失真问题,时空转录组FFPE V1.1通过芯片探针和实验流程的优化,实现了高精度的空间定位。

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3. 数据利用率提升100%,高性价比实现全景式数据支持

时空转录组FFPEV1.1通过探针设计优化,新的测序建库流程与生信分析工具开发等方法将有效数据利用率提升了100%,显著降低无效测序损耗(如无效CID序列、rRNA序列等),实现科研级数据的高性价比获取,为复杂疾病机制研究提供全景式数据支持。

4. 多类型样本混测兼容,FF与FFPE样本“一机双测”

时空转录组FFPE V1.1首次支持新鲜冷冻(FF)样本与福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本同批次测序。通过优化建库试剂盒与建库方案,研究人员可在单张T7测序芯片上同步检测FF与FFPE来源的时空文库,极大提升了实验灵活性与测序效率,不再为“凑样”上机烦恼。

/聚焦核心临床应用场景/

时空转录组FFPE V1.1可稳定实现组织芯片蜡块(TMA)的高通量分析。单张芯片可集成多个样本位点,结合纳米级分辨率,可在单次实验中完成大队列样本的空间转录组分析,有望成为新药研发与回顾性大队列研究加速器。

该产品方案目前已在大部分临床常见的病理样本、小鼠组织中得到稳定的验证,且无物种限制,可应用在疾病研究、细胞图谱、生物标志物研究、宿主与微生物互作研究、非编码RNA调控研究等领域,有望实现从病理诊断到精准治疗的闭环

吉因加时空转录组FFPE V1.1全流程检测服务已正式上线。需要开展科研服务的老师,可以扫描以下二维码进行咨询哦。

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/关于吉因加科技服务/

吉因加,一直致力于成为临床科学家最佳合作伙伴。

在自身的发展进程中,吉因加始终与临床科学家紧密携手,凭借对临床问题的深刻洞察,深度扎根于技术的自主创新,精心打造出两条临床科研产品管线:泛组织和泛液体活检。秉持临床研究与转化应用并重的理念,在肾脏疾病、心脑血管疾病、代谢疾病、自身免疫疾病以及肿瘤等诸多疾病范畴内,紧扣临床研究与转化应用的前沿热点课题,创新性勾勒出复杂疾病的科研蓝图,支撑临床科学家真正实现从复杂疾病的临床研究与应用转化的落地。

吉因加目前已经和全球500多家科研院校、医院、企业等单位开展业务合作,发表Sci论文400余篇,影响因子3800+,专利、软著全球授权超过180多项。吉因加重视与临床科学家的合作,参与共同制定《中国HRD标准化项目》、《实体瘤MRD检测病理专家共识》等多部行业标准和专家共识,成功与临床科学家共同完成 “国家科技创新2030”重点专项等项目的申报。未来吉因加科技将持续专注在疾病的临床研究与转化应用,与临床医学科学家一起推动医学的发展与进步,为患者带来更获益更可及的技术与服务。