在肿瘤整片、大器官切面、组织微阵列等研究中，样本往往超出常规芯片的覆盖范围。将组织分区检测后再进行数据拼接，不仅会增加实验批次和数据处理环节，也可能割裂原本连续的空间关系。

为此，华大智造时空组学正式推出时空转录组FFPE V1.1大尺寸芯片产品方案，为大尺寸FFPE组织研究提供更完整的空间视野。

三种规格正式上市

本次上市的FFPE V1.1大尺寸芯片提供1 cm × 2 cm、2 cm × 2 cm和2 cm × 3 cm三种规格，并支持尺寸定制。研究者可根据切片大小和组织形态选择合适规格，减少不必要的样本分割和多片拼接。

时空转录组FFPE V1.1大尺寸芯片上市规格

注：1 cm × 2 cm、2 cm × 2 cm和2 cm × 3 cm为本次上市规格；定制尺寸需结合样本与项目需求评估。

一张芯片 看见更完整的组织空间

芯片变大，意义不只是“放得下”。当更大范围的组织能够在同一次实验中完成捕获，研究者可以在统一坐标系下同时观察整体结构、局部差异以及区域之间的连续变化。

减少切分与拼接。更大的组织覆盖范围有助于减少分区实验及后续拼接，降低额外批次和跨片整合带来的影响。

兼顾整体视野与局部结构。方案在扩大覆盖范围的同时，保持500 nm级空间分辨能力，可用于组织结构解析、细胞群识别及局部区域比较。

支持空间单细胞尺度分析。FFPE V1.1通过原位捕获Total RNA，为捕获到的转录本赋予空间坐标；结合Cellbin等分析，可在空间单细胞尺度开展细胞群识别、注释和微环境分析。

基于更大的组织覆盖范围和连续空间信息保留能力，该方案更适合以下研究场景：

大尺寸芯片可服务于肿瘤整片、大器官及连续组织、组织微阵列及组织拼图，以及珍贵FFPE队列等研究。它们的共同需求，是在更连续的组织背景中比较细胞群、区域差异与微环境信号。

时空转录组FFPE V1.1大尺寸芯片适用研究场景

代表性样本测试结果

以下为时空转录组FFPE V1.1大尺寸芯片在两类样本中的代表性测试结果。

小鼠胚胎FFPE大尺寸切片

在2 cm × 2 cm芯片的小鼠胚胎FFPE样本测试中，单样本获得约14,000 M reads，检测到29,000个以上基因；Bin200中位基因数超过12,000，Cellbin中位基因数超过670，Valid CID超过84%。

小鼠胚胎FFPE大尺寸切片代表性测试结果

组织微阵列

在1 cm × 2 cm芯片的组织微阵列测试中，单样本获得约12,000 M reads，Q30超过95%；共获得450,000个以上Cellbin，Cellbin中位基因数约为300，并识别出30个以上细胞簇。

组织微阵列代表性测试结果

不同尺寸的FFPE样本，在组织尺度、样本数量和研究目标上各有差异，对芯片规格、实验流程与分析方案也提出了不同需求。如何从常规尺寸到大视场，为不同研究场景选择更匹配的空间研究方案？

9月23日14:00—14:30，华大智造时空组学产品经理康芮将从FFPE空间研究场景出发，介绍常规尺寸芯片与不同规格大尺寸芯片的应用特点。同时，结合小鼠胚胎、多组织及多样本等案例，分享FFPE时空转录组从单一产品向多场景解决方案拓展的实践思路。

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注：9:00为网络研讨会开播时间，本场报告时间为14:00—14:30。

面向FFPE，大尺寸覆盖 × 高分辨率 × 全转录组检测

时空转录组FFPE V1.1大尺寸芯片，并非简单地“把芯片做大”。它在实现厘米级组织覆盖的同时，延续Stereo-seq的500 nm级空间分辨能力与全转录组检测优势，让“看得广”与“看得清”在同一张芯片上兼得。

大尺寸芯片拓展的不只是组织覆盖范围，更是研究者在连续空间中理解细胞、组织结构与微环境关系的边界。让珍贵的FFPE存档样本不止被保存，也能在新的空间维度中被重新理解，为疾病机制研究与转化探索提供更丰富的线索。