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时空转录组FF空间基因表达,小鼠卵巢(新鲜冷冻)

试剂盒版本号:Stereo-seq T FF V1.3,软件版本号:SAW 8.1 & StereoMap 4.1
小鼠卵巢演示数据
芯片号:B04372C211
样品信息
试剂盒信息
实验信息
测序信息
分析结果
染色图及原始数据下载
数据详情
样品信息
物种类型
小鼠(品系:C57BL/6;性别:雌;年龄:6-8周)
组织类型
卵巢
包埋方式
新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定
RIN值
9.49
试剂盒信息
产品方案
时空转录组FF
试剂盒版本
Stereo-seq T FF V1.3
芯片尺寸
0.5 cm × 0.5 cm
实验信息
切片厚度
10 μm
染色方案
H&E染色
透化时间
12 min
测序信息
Total reads
238,585,596
测序仪
MGISEQ-2000RS
分析结果
小鼠卵巢演示数据 小鼠卵巢演示数据 小鼠卵巢演示数据
聚类图
  • 分析软件版本SAW 8.1,StereoMap 4.0
  • Bin200(100 µm) MID中位数68,513
  • Bin200(100 µm) 基因中位数10,392

  • 每个细胞基因中位数654
  • 每个细胞MID中位数1,041
  • 测序饱和度:43.10%
  • 组织覆盖率:74.66%
输入文件 输出及补充文件
输入文件 格式 大小 md5sum
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输出及补充文件 格式 大小 md5sum
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