STOmics logo 时空组学

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时空转录组
纳米级分辨率,厘米级全景视场
时空试剂套装包含透化试剂套装及转录组试剂套装。
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纳米级分辨率,厘米级全景视场
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时空转录组
首页> 产品>试剂>时空转录组
产品介绍 产品亮点 成果解读 演示数据 操作流程 结果展示 常见问答
探索空间生物学
时空试剂产品包含了Stereo-seq技术流程所需的主要时空试剂和时空芯片,其中时空芯片上载有具有空间坐标信息的捕获探针,与组织切片结合后通过探针原位抓取组织内的 mRNA 分子并进行 cDNA 合成。研究人员通过 DNBSEQ 测序和 STOmics 配套的可视化分析工具,可获取特定样本超高分辨率下的空间转录组信息。
探索空间生物学
产品亮点
大视场和高分辨率
大视场和高分辨率
实现500 nm分辨率,同时捕获面积最大可达13 cm×13 cm,且实现了基因与影像同时分析。
高兼容性
高兼容性
时空组学技术在新鲜冷冻保存的多种动植物细胞、器官以及胚胎切片上都有良好的表现。
精简的数据分析
精简的数据分析
时空云平台进行时空数据分析、可视化及数据挖掘,也可使用STOmics分析流程软件(SAW)自行对分析获得时空基因表达矩阵。
操作便捷
操作便捷
整体生化流程便捷性增强。
演示数据
演示数据
大鼠鼠脑
  • 组织切片:101.233 mm²

  • 空间条码(CIDs)数量:175.9M

  • 基因数:1638(bin 50)

  • 芯片尺寸:2 cm × 3 cm

演示数据
小鼠嗅球
  • 组织切片:7.942 mm²

  • 空间条码(CIDs)数量:13.1M

  • 基因数:1447(bin 50)

  • 芯片尺寸:0.5 cm × 0.5 cm

演示数据
小鼠大脑
  • 组织切片:10.5 mm²

  • 空间条码(CIDs)数量:15.3M

  • 基因数:578(bin 14,14×14 DNB,约为1个细胞的大小)

  • 芯片尺寸:1 cm × 1 cm

操作流程
操作流程 操作流程 操作流程
常见问答
Q 包埋过程应注意什么? 展开 收起
A

 包埋过程中需注意取材尺寸 ( 目前要求组织块尺寸不得大于 0.9 cm x 0.9 cm x 2 cm),选择合适尺寸的包埋盒。新鲜组织离体后需在 30 min内完成包埋,操作时应在低温环境下快速进行,避免 RNA 降解。包埋前应吸干组织表面水分,避免产生冰晶,同时也要避免 OCT 中气泡的产生影响后续切片。

Q 组织形态变型严重是何原因? 展开 收起
A

组织形态严重变形可能是取材过程中对组织造成了挤压,应该调整取样方式;也可能是包埋过程包埋剂膨胀挤压组织造成变形,应根据具体情况调整包埋条件,如更换尺寸材质合适的包埋盒等。

Q 组织包埋块中冰晶过多如何避免? 展开 收起
A

取材后包埋前尽量将组织表面的水分吸干。缓慢的冰冻过程会导致较大冰晶的形成,建议组织包埋过程中,迅速冷冻。

Q 组织包埋时,OCT 的量是否会对组织造成影响? 展开 收起
A

组织太小 OCT 太多的话,可能会对组织产生挤压。建议尽量选择跟组织大小适配的包埋盒。

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