小鼠胚胎演示数据

时空转录组FF空间基因表达，小鼠胚胎（新鲜冷冻）

试剂盒版本号：Stereo-seq T FF V1.3，软件版本号：SAW 8.1 & StereoMap 4.1

时空转录组大尺寸芯片

小鼠胚胎演示数据

芯片号：D05103C4D4

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：

小鼠（品系：C57BL/6；性别：雌；年龄：E18.5）

组织类型：

胚胎

包埋方式：

新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定

RIN值：

8.4

试剂盒信息

产品方案：

时空转录组大尺寸芯片

试剂盒版本：

Stereo-seq T FF V1.3

芯片尺寸：

1 cm × 2 cm

实验信息

切片厚度：

10 μm

染色方案：

H&E染色

透化时间：

12 min

测序信息

Total reads：

4,122,777,778

测序仪：

DNBSEQ-T7RS

分析结果

聚类图

分析软件版本：SAW 8.1，StereoMap 4.1
Bin200(100 µm) MID中位数：82,562
Bin200(100 µm) 基因中位数：10,952
每个细胞基因中位数：433
每个细胞MID中位数：569
测序饱和度：13.20%
组织覆盖率：88.23%
手动说明：组织分割经过手动修正，细胞分割采用第三方工具的分割结果

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输入文件输出及补充文件

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