Go Spatial小鼠肾脏演示数据 Y40568D8 - 华大时空

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Go Spatial转录组FFPE，福尔马林固定石蜡包埋小鼠肾脏

试剂盒版本号：Stereo-seq N FFPE V1.1，软件版本号：SAW 8.2 & StereoMap 4.2

时空转录组FFPE

Go Spatial小鼠肾脏演示数据

芯片号：Y40568D8

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：小鼠（品系：C57BL/6；性别：雄；年龄：6-8周）
组织类型：肾脏
包埋方式：福尔马林固定石蜡包埋
DV200 ＞ 70%

试剂盒信息

产品方案：时空自动化样本处理系统转录组FFPE
试剂盒版本：Stereo-seq N FFPE V1.1
芯片尺寸：1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：5 μm
染色方案：ssDNA染色
透化时间：30 min

测序信息

Total Reads：1,724,553,246
测序仪：MGISEQ-2000RS

分析结果

聚类图

分析软件版本：SAW 8.2,StereoMap 4.2
Bin200 (100 µm) MID中位数：44,237
Bin200 (100 µm) 基因中位数：9,430
Bin20 (10 µm) MID中位数：419
Bin20 (10 µm) 基因中位数：305
每个细胞基因中位数：240
每个细胞MID中位数：317
测序饱和度：58.9%
组织覆盖率：89.69%

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输入文件输出及补充文件

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