IGV
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IGV
IGV工具是基因组数据可视化工具,支持多种测序数据的交互展示。
IGV工具入口
进入到个人项目后,点击交互分析模块,选择IGV工具使用。

点击运行,首次使用会加载一段时间,展示提供的demo示例数据,提供四个按钮:Genome、Track、Help和Save。

Genome:基因组文件的选择(默认仅提供humanGRCH38和GRCH37两个版本)也可自行构建ref来使用
Track:个人变异位点的分析数据(当前仅支持vcf.gz及其索引文件vcf.tbi)的加载
Help:软件的官方手册和操作使用说明
Save:保存变异位点的图片到数据管理
注意
当前工具仅支持vcf.gz及其索引文件vcf.tbi的可视化查看,暂不支持其他数据格式。
除从交互分析入口进入外,也可从数据管理点击vcf.gz数据进入可视化界面。
详细使用操作引导可参考Help模块官方的指引说明。