今年9月，时空转录组FFPE V1.1产品方案正式发布。这是继2024年6月首版方案发布后，华大时空在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本领域取得的又一次重大突破。
时空转录组FFPE V1.1的实际数据表现如何？一起来看看华大时空生态合作伙伴康圣序源的实测结果吧。
/康圣序源实测数据展示/
时空转录组FFPE V1.1推出后，康圣序源迅速开展验证测试。实测数据显示，新版产品在rRNA Reads占比显著下降，有效数据利用率、基因捕获效率等多项指标上均有显著提升。
实测数据1：rRNA Reads占比显著下降约50%
实测数据2：有效数据利用率提升100%，康圣序源实测样本中的Valid ClD提升了20%-30%
时空转录组FFPEV1.1通过探针设计优化，新的测序建库流程与生信分析工具开发等方法将有效数据利用率翻倍提升，显著降低无效测序损耗（如无效CID序列、rRNA序列等），实现科研级数据的高性价比获取，为复杂疾病机制研究提供全景式数据支持。
实测数据3：基因捕获效率大幅提升，康圣序源实测样本中，Median Gene Type per Bin50提升约200%；Mean Gene per Bin50提升约150%
/时空转录组FFPE V1.1升级亮点/
01. 基因捕获效率提升100%，破解FFPE样本“沉默黑匣”
传统技术对FFPE样本的RNA捕获效率较低，时空转录组FFPE V1.1通过优化探针设计及生化反应效率等方法，在保持编码&非编码RNA捕获，微生物捕获等性能的基础上，基因捕获效率相比上一版本提升50%-200%。
02. 组织内外信号扩散优化，空间定位精度达纳米级
针对FFPE样本中RNA扩散导致的空间定位失真问题，时空转录组FFPE V1.1通过芯片探针和实验流程的优化，实现了高精度的空间定位。
03. 数据利用率提升100%，高性价比实现全景式数据支持
时空转录组FFPEV1.1通过探针设计优化，新的测序建库流程与生信分析工具开发等方法将有效数据利用率提升了100%，显著降低无效测序损耗（如无效CID序列、rRNA序列等），实现科研级数据的高性价比获取，为复杂疾病机制研究提供全景式数据支持。
04. 多类型样本混测兼容，FF与FFPE样本“一机双测”
时空转录组FFPE V1.1首次支持新鲜冷冻(FF)样本与福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本同批次测序。通过优化建库试剂盒与建库方案，研究人员可在单张T7测序芯片上同步检测FF与FFPE来源的时空文库，极大提升了实验灵活性与测序效率，不再为“凑样”上机烦恼。
/锁定前沿技术，抢占科研先机/
华大时空组学生态合作伙伴康圣序源现可提供时空组学Stereo-FFPE V1.1空间转录组服务。如果您有科研项目需求，可通过以下方式进行联系：
邮箱：info@kindstar-seq.com 电话：15074920312
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/关于康圣序源/
康圣序源生物科技（武汉）有限公司是康圣环球旗下的医学多组学科研服务及临床LDT转化的子公司。康圣序源核心团队均毕业于海内外生命医学领域知名高校，员工硕博比例达60%以上。全体员工人均拥有5年以上多组学科研服务从业经验，在三代测序、NGS、单细胞测序、三代单细胞MAS-Seq和时空组学等领域有着自己的优势和特色，同时公司配置了一个项目经验丰富的生物信息高级分析和文章提升服务团队。
康圣序源配备有二代测序平台DNBSEQ-T7、三代测序平台DNBelab C-TaiM 4，以及STOmics时空组学一体化平台，流式分选仪及数字PCR等仪器。康圣序源测序中心将面向国内外生物领域的研究者、医院、科研机构和生物制药企业提供全面而丰富的多组学科研服务。
*内容转载自公众号：康圣序源
