Go Spatial小鼠胚胎演示数据 Y10326J4 - 华大时空

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Go Spatial转录组FF，新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定小鼠胚胎

试剂盒版本号：Stereo-seq T FF V1.3，软件版本号：SAW 8.2 & StereoMap 4.2

时空转录组FF

Go Spatial小鼠胚胎演示数据

芯片号：Y10326J4

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：小鼠（品系：C57BL/6；性别：雌；年龄：E18.5）
组织类型：胚胎
包埋方式：新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定
RIN 值：8.4

试剂盒信息

产品方案：时空自动化样本处理系统转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
芯片尺寸：1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：10 μm
染色方案：ssDNA染色
透化时间：20 min

测序信息

Total Reads：1,912,506,170
测序仪：MGISEQ-2000RS

分析结果

聚类图

Bin200 (100 µm) MID中位数：83,657
Bin200 (100 µm) 基因中位数：9,864
Bin20 (10 µm) MID中位数：844
Bin20 (10 µm) 基因中位数：492
每个细胞基因中位数：400
每个细胞MID中位数：669
测序饱和度：44.2%
组织覆盖率：91.00%
手动说明：本演示数据基于 SAW 标准分析结果，经过组织分割人工修正及 Cellbin 人工注释。

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输入文件输出及补充文件

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