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Cell | Stereo-seq助力绘制果蝇发育3D全景图谱，破译生命动态调控的“时空密码”

6月26日，杭州华大生命科学研究院联合南方科技大学，在国际顶级学术期刊Cell发表突破性成果。研究团队通过华大时空组学技术Stereo-seq及多种单细胞组学测序技术，开创性地创建了一个解码动物发育过程的多模态数据集，生成了果蝇全发育周期的3D单细胞时空多组学图谱。该研究成果系统解析了果蝇细胞类型分化的时空动态与核心调控网络，为发育生物学研究提供了前所未有的分子层面参考，并为发育缺陷及相关疾病机制研究奠定了重要基础。

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Science重磅 | Stereo-seq助力揭示小鼠耳廓再生关键基因，破解哺乳动物再生能力丢失之谜

北京时间6月27日，北京华大生命科学研究院联合北京生命科学研究所，基于华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq和高通量测序平台DNBSEQ-T10，首次发现Aldh1a2基因的表达不足导致的视黄酸合成不足是高等哺乳动物小鼠耳廓再生失败的核心机制。在激活该基因后，小鼠耳廓实现再生！这为深入理解进化过程中哺乳动物的再生能力丢失提供了新的见解，并为再生医学和人类受损器官的重建与再生提供了重要靶标。相关成果发表于国际顶级学术期刊Science。

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再登Cell！全球顶刊连续关注的3D重构，为何这项技术成为破局关键？

与传统二维空间组学相比，3D重构技术不仅能获取细胞的空间位置信息，还能解析组织的三维形态结构（如厚度、外形等），从而系统阐释细胞及分子活动在组织整体中的空间关联。3D图谱研究中提供的真实的器官形态学与结构学数据，在组织器官发育研究中也具有重要价值。因此，3D重构正逐渐成为当下生命科学研究的 “刚需”。华大时空组学技术Stereo-seq，凭借高分辨率空间定位、单细胞水平分析等优势，为开展3D重构研究提供了有力工具。在胚胎发育研究中，Stereo-seq是如何助力研究人员实现3D重构的？一起来解锁吧。

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Cell重磅丨华大时空组学技助力构建“3D数字胚胎”，揭示器官发育关键调控信号

6月18日，东南大学联合华大生命科学研究院、福建省妇幼保健院、四川大学、中国香港中文大学（深圳）等机构组成的科研团队，在国际顶级学术期刊Cell发表小鼠胚胎发育研究成果。在这项被评审人称为“史无前例”的研究中，研究团队利用华大时空组学技术Stereo-seq，成功构建全球首个单细胞精度的小鼠“3D数字胚胎”，并首次揭示了影响小鼠心脏、前肠等器官原基发育的关键信号。该研究成果为哺乳动物早期器官发育提供重要参考图谱，更为先天性心脏病等出生缺陷防治提供基础科学依据。

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创新算法StereoMM | 高效整合空间转录组数据与病理图像，助力肿瘤精准治疗研究与临床应用

近日，西南华大生命科学研究院等机构在国际生物信息学期刊《生物信息学简报》（Briefings in Bioinformatics）联合发表研究，介绍了一种名为StereoMM的创新算法。该方法通过深度学习框架开创性地实现了转录组数据与病理特征的融合，实现对空间域的精确识别，并在患者分类任务中展现出良好的判别性能。这一进展有望为肿瘤精准治疗等医学研究领域带来新的可能性。

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封面文章 | 肺移植术后“72小时生死线”，Stereo-seq助力重症PGD找到新突破！

近日，上海市肺科医院和北京华大生命科学研究院等组成的研究团队，利用华大自主研发的单细胞测序技术DNBeLab C4、时空组学技术Stereo-seq和超高通量测序平台DNBSEQ-Tx，锁定导致肺损伤的“罪魁祸首”——CD177+中性粒细胞，并发现了预测重症PGD的潜在生物标志物以及治疗靶点。相关研究成果以封面文章的形式发表在国际知名学术期刊Cell Reports Medicine上。

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Dev. Cell | Stereo-seq助力构建羊膜类跨物种单细胞图谱，解密3.2亿年大脑演化之谜

5月13日，华大生命科学研究院联合中国科学院深圳先进技术研究院、郑州大学生命科学学院、中国科学院脑科学与智能技术卓越中心等机构，共同揭开了这场跨越3.2亿年的大脑神经元演化之谜。相关论文在Developmental Cell发表。

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Nat. Commun | Stereo-seq助力解析蜜蜂社会行为分化过程中基因调控网络的空间异质性

近日，中国农业大学、青岛华大基因研究院等单位合作，在Nature Communications上发表了题为“Single-nucleus and spatial transcriptomics identify brain landscape of gene regulatory networks associated with behavioral maturation in honeybees”的研究论文。

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Nature子刊 | 首次揭示人类颈动脉斑块中三级淋巴器官！Stereo-seq新突破

近日，北京华大生命科学研究院联合北京协和医院血管外科，通过华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq和单细胞RNA测序技术，首次鉴定出人类颈动脉粥样硬化斑块中三级淋巴器官（PTLOs）的存在，为深入理解动脉粥样硬化的免疫机制提供了关键资源，并为精准干预提供了新的潜在靶点。成果发表于Nature Cardiovascular Research。

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Nature Plants | Stereo-seq助力首次构建植物发育花芽时空转录组图谱并重建其细胞谱系

近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所杨学勇研究员团队，联合华大生命科学研究院等研究团队，在Nature Plants发表了题为“Developmental innovation of inferior ovaries and flower sex orchestrated by KNOX1 in cucurbits”的研究论文。该研究利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，首次构建植物发育花芽时空转录组图谱并重建其细胞谱系，揭示了黄瓜花居间分生组织活性驱动了花托加速生长，进而决定雌花发育与下位子房形成，同时提出了膨大花托是葫芦科植物单性花与下位子房形成的关键演化特征。

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