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Plant Biotechnol. J. | Stereo-seq助力首次构建非模式植物花生的空间转录组图谱

该研究利用Stereo-seq并结合自主开发的适用于植物样本的空间转录组样本制备技术，首次构建了花生的高分辨率空间转录组图谱，系统的表征了花生特有器官果针与根、茎以及下胚轴的空间分布及基因表达异质性。通过比较果针的尖端和基底部分的表皮和外皮的差异，揭示了花生同一类型的细胞具有基因表达的高度差异，并进一步表征了花生茎形成层细胞具有向导管和筛管双向分化的能力。该研究为植物发育的分子机理和功能基因组学的深入研究奠定了基础。

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Sci. Adv. | Stereo-seq揭示肾上腺髓质素在胎盘发育和早发型子痫前期发病机制中的作用

近日，香港大学深圳医院赵志昂（Philip C.N.Chiu）团队和华大生命科学研究院高雅团队合作，利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq探索了肾上腺髓质素（adrenomedullin，ADM）作为早发型子痫前期（early-onset preeclampsia，EOPE）预测标记的潜在用途，并验证了一种基于胎盘特异性的新型纳米颗粒靶向给药方法，该方法可以降低小鼠模型中的EOPE样表型。该研究提供了单细胞分辨率下胎盘绒毛细胞的空间图谱，揭示了ADM作为一种功能丰富的胎盘肽，在胎盘发育和EOPE发病机制中发挥着至关重要的作用，为EOPE的潜在机制提供了宝贵的见解，并为这种严重妊娠并发症的早期预测和治疗提供了潜在的策略。

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Fundamental Research | Stereo-seq揭示错配修复系统完善型结直肠腺癌的空间免疫异质性

华大生命科学研究院联合中山大学肿瘤防治中心、华南恶性肿瘤防治全国重点实验室等多家科研单位，利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq和单细胞转录组测序技术DNBelab C4绘制了错配修复系统完善型（proficient-mismatch repair，pMMR）结直肠腺癌的空间转录组图谱，揭示了恶性粘膜中的不连续炎症模式，表征了免疫“热”区的分子特征，为后续改善pMMR肿瘤在免疫检查点阻断治疗中的不敏感性提供了理论基础。

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Nature Genetics | Stereo-seq助力首次绘制洋葱鳞茎组织不同发育阶段时空图谱

西北工业大学研究团队联合华大生命科学研究院，利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq首次绘制了洋葱鳞茎组织不同发育阶段的时空图谱，揭示了葱属植物重要性状形成和演化的分子机制。该研究为进一步了解葱属植物提供了重要资源，并提供了对这些重要农作物的生物学和育种的新见解。该研究在2023年11月06日发表于Nature Genetics，以下是该文章的详细解读。

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直肠癌研究新突破！中山六院联合华大为直肠癌治疗提供重要线索

10月18日，华大生命科学研究院联合中山大学第六附属医院，在Cell Press出版社旗下的医学子刊 Cell Reports Medicine 上发表直肠癌最新研究成果。研究团队基于华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq及单细胞建库平台DNBelab C4，揭示了直肠癌在新辅助化疗下，肿瘤微环境的动态变化图谱和耐药性影响。

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PNAS | Stereo-seq揭示番茄愈伤组织的芽再生空间转录组图谱

近日，北京大学现代农业研究院的李博生研究员团队、邓兴旺院士团队及华大生命科学研究院夏科科研究员团队使用Stereo-seq生成的精细空间单细胞数据（通过单细胞分割共获得28,036个单细胞，覆盖19,821个基因）首次探索了番茄愈伤组织在芽再生培养过程后期样本的空间转录组，发现愈伤组织内存在高度异质性的细胞群体，包括表皮、维管组织、芽原基、成熟芽和内部愈伤组织，提升了对番茄愈伤组织中芽再生时期的细胞和分子方面的理解，揭示了绿色组织（chlorenchyma）细胞在芽原基细胞位置决定和分化发育中的重要作用，并展示了空间转录组在植物生物学研究中的巨大潜力。

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TPJ前沿综述 | 空间转录组学推进植物研究进入新时代

近日，华大生命科学研究院徐讯研究员团队受邀在国际期刊The Plant Journal上发表了一篇综述文章《Spatial transcriptomics leading the new era in plant research》，从技术发展、技术优势和应用的角度详细介绍了空间转录组学（Spatial Transcriptomics，ST）在植物研究中的最新进展和挑战，以及未来的应用展望。

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Cell重磅 | Stereo-seq助力杜鹏课题组解析妊娠早期子宫微环境的建立和稳态维持

2023年9月11日，北京大学生命科学学院和北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员杜鹏课题组在Cell Press细胞出版社旗下期刊Cell上在线发表了题为“Spatiotemporal insight into early pregnancy governed by immune-featured stromal cells”的研究论文。

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Current Medicine | 空间转录组学在生物医学及临床研究中的应用

近日，华大生命科学研究院团队在《Current Medicine》在线发表了题为“Spatial transcriptomics in human biomedical research and clinical application”的综述文章。该文章针对生命科学领域当前最热门的技术——空间转录组学（ST）展开论述，探讨了其如何以时空方式跟踪疾病发生发展的机制，探寻疾病特异性生物标记物，以及对该技术未来的发展前景，为研究者在疾病研究领域更好地利用该技术提供了参考。

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Cell | 成年猕猴全脑皮层单细胞分辨率空间图谱揭示细胞组织模式

中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）与华大生命科学研究院、临港实验室、上海脑科学与类脑研究中心、腾讯AI Lab、瑞典皇家理工学院、卡罗林斯卡医学院等单位联合，通过对成年雄性猕猴的大脑左半球进行冠状切片，结合华大自主研发的高分辨率时空组学Stereo-seq和snRNA-seq，绘制了全球首个非人灵长类全脑皮层空间单细胞图谱。

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