大鼠脑演示数据 - 华大时空

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时空转录组FF空间基因表达，大鼠脑（新鲜冷冻）

试剂盒版本号：Stereo-seq T FF V1.2，软件版本号：SAW 7.0 & StereoMap 3.0

时空转录组大尺寸芯片

大鼠脑演示数据

芯片号：B01207E3G4

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：

大鼠（品系：SD；性别：雄；年龄：6-8周）

组织类型：

脑

包埋方式：

新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定

RIN值：

7.0

试剂盒信息

产品方案：

时空转录组大尺寸芯片

试剂盒版本：

Stereo-seq T FF V1.2

芯片尺寸：

2 cm × 3 cm

实验信息

切片厚度：

10 μm

染色方案：

DAPI染色

透化时间：

12 min

测序信息

Total reads：

28,020,201,071

测序仪：

DNBSEQ-T20

分析结果

聚类图

分析软件版本：SAW 7.0，StereoMap 3.0
Bin200(100 µm) MID中位数：68,103
Bin200(100 µm) 基因中位数：8,217
每个细胞基因中位数：514
每个细胞MID中位数：1,031
测序饱和度：93.60%
组织覆盖率：84.60%

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输入文件输出及补充文件

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