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时空蛋白转录组Stereo-CITE空间基因表达，小鼠胸腺（新鲜冷冻）

试剂盒版本号：Stereo-CITE T FF V1.0，软件版本号：SAW 8.1 & StereoMap 4.1
时空蛋白转录组Stereo-CITE
小鼠胸腺演示数据
芯片号：A02677B5
样品信息
试剂盒信息
实验信息
测序信息
分析结果
染色图及原始数据下载
数据详情
样品信息
物种类型：
小鼠（品系：C57BL/6；性别：雄；年龄：6-8周）
组织类型：
胸腺
包埋方式：
新鲜组织OCT包埋切片去做PFA固定
RIN值：
8.5
试剂盒信息
产品方案：
时空蛋白转录组Stereo-CITE
试剂盒版本：
Stereo-CITE T FF V1.0
芯片尺寸：
1 cm × 1 cm
实验信息
切片厚度：
10 μm
染色方案：
DAPI染色
透化时间：
14 min
测序信息
Total reads：
1,346,328,616（RNA）、1,307,126,096（蛋白）
测序仪：
DNBSEQ-T7RS、MGISEQ-2000RS
分析结果
小鼠胸腺演示数据 小鼠胸腺演示数据 小鼠胸腺演示数据
聚类图

  • 分析软件版本：SAW 8.1，StereoMap 4.1

  • 投入蛋白数：128

  • Bin200(100 µm) MID中位数：122,252（RNA）、117,648（蛋白）
  • Bin200(100 µm) 基因中位数：10,158
  • 每个细胞基因中位数：277
  • 每个细胞MID中位数：543（RNA）、540（蛋白）
  • 测序饱和度：53.10%

  • 组织覆盖率：72.06%

  • 手动说明：组织分割经过手动处理

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 输出及补充文件 格式 大小 md5sum
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