小鼠胸腺演示数据

时空蛋白转录组Stereo-CITE空间基因表达，小鼠胸腺（新鲜冷冻）

试剂盒版本号：Stereo-CITE T FF V1.0，软件版本号：SAW 8.1 & StereoMap 4.1

时空蛋白转录组Stereo-CITE

小鼠胸腺演示数据

芯片号：A02677B5

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：

小鼠（品系：C57BL/6；性别：雄；年龄：6-8周）

组织类型：

胸腺

包埋方式：

新鲜组织OCT包埋切片去做PFA固定

RIN值：

8.5

试剂盒信息

产品方案：

时空蛋白转录组Stereo-CITE

试剂盒版本：

Stereo-CITE T FF V1.0

芯片尺寸：

1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：

10 μm

染色方案：

DAPI染色

透化时间：

14 min

测序信息

Total reads：

1,346,328,616（RNA）、1,307,126,096（蛋白）

测序仪：

DNBSEQ-T7RS、MGISEQ-2000RS

分析结果

聚类图

分析软件版本：SAW 8.1，StereoMap 4.1
投入蛋白数：128
Bin200(100 µm) MID中位数：122,252（RNA）、117,648（蛋白）
Bin200(100 µm) 基因中位数：10,158
每个细胞基因中位数：277
每个细胞MID中位数：543（RNA）、540（蛋白）
测序饱和度：53.10%
组织覆盖率：72.06%
手动说明：组织分割经过手动处理

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输入文件输出及补充文件

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