小鼠脑演示数据 - 华大时空

时空转录组FFPE空间基因表达，小鼠脑（福尔马林固定石蜡包埋）

试剂盒版本号：Stereo-seq N FFPE V1.0，软件版本号：SAW 8.1 & StereoMap 4.1

时空转录组FFPE

小鼠脑演示数据

芯片号：C04138G3

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：

小鼠（品系：C57BL/6；性别：雄；年龄：6-8周）

组织类型：

全脑

包埋方式：

福尔马林固定石蜡包埋

DV200：

>70%

试剂盒信息

产品方案：

时空转录组FFPE

试剂盒版本：

Stereo-seq N FFPE V1.0

芯片尺寸：

1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：

5 μm

染色方案：

H&E染色

透化时间：

30 min

测序信息

Total reads：

3,188,213,166

测序仪：

DNBSEQ-T7RS

分析结果

空间表达热图

分析软件版本：SAW 8.1，StereoMap 4.1
Bin200(100 µm) MID中位数：41,791
Bin200(100 µm) 基因中位数：6,174
Bin20(10 µm) MID中位数：383
Bin20(10 µm) 基因中位数：177
测序饱和度：78.7%
组织覆盖率：95.61%
手动说明：组织分割经过手动处理

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输入文件输出及补充文件

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