小鼠肺演示数据 - 华大时空

时空转录组FFPE空间基因表达，小鼠肺（福尔马林固定石蜡包埋）

试剂盒版本号：Stereo-seq N FFPE V1.0，软件版本号：SAW 8.1 & StereoMap 4.1

时空转录组FFPE

小鼠肺演示数据

芯片号：C04495G4

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：

小鼠（品系：C57BL/6；性别：雌；年龄：4-8周）

组织类型：

肺

包埋方式：

福尔马林固定石蜡包埋

DV200：

>70%

试剂盒信息

产品方案：

时空转录组FFPE

试剂盒版本：

Stereo-seq N FFPE V1.0

芯片尺寸：

1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：

5 μm

染色方案：

H&E染色

透化时间：

30 min

测序信息

Total reads：

2,936,941,526

测序仪：

DNBSEQ-T7RS、MGISEQ-2000RS

分析结果

空间表达热图

分析软件版本：SAW 8.1，StereoMap 4.1
Bin200(100 µm) MID中位数：36,892
Bin200(100 µm) 基因中位数：5,299

Bin20(10 µm) MID中位数：369
Bin20(10 µm) 基因中位数：110

测序饱和度：75.10%
组织覆盖率：68.58%

立即探索查看报告 >

输入文件输出及补充文件

输入文件	格式	大小	md5sum
C04495G4_input_command_download	TXT	6.45KB	f3ae55786a852077137ced0ebd9cf75e
C04495G4.barcodeToPos.h5	H5	2.86GB	5aa2f25a259ed6e2cb9622a7f2edff30
C04495G4_SC_20240822_111031_4.0.1.tar.gz	TAR	1.23GB	2f3e4a503b020e754b305e5a84e98357
E250018389_L01_13_1.fq.gz	FQ	9.13GB	74c639f439bc67893c21b1790de50752
E250018389_L01_13_2.fq.gz	FQ	16.74GB	d081adcdec541ca162480bbd69c4e8c2
E250018389_L01_16_1.fq.gz	FQ	9.78GB	52f21343e7cfa0abc45f8c9c2cbf501b
E250018389_L01_16_2.fq.gz	FQ	17.85GB	86e226242999404eac5d23219707c8b4
V350296372_L01_read_1.fq.gz	FQ	7.46GB	b89e13b51c07e7efc8f9d74c29dfe673
V350296372_L01_read_2.fq.gz	FQ	16.84GB	b956823b4aebe35dfc214f1148af794b
V350296372_L02_read_1.fq.gz	FQ	7.21GB	abc423fb5b00c64599ebb86b96d3ee42
V350296372_L02_read_2.fq.gz	FQ	16.32GB	5573f38f8aecc49f34570e6a9d9e3566
V350296372_L03_read_1.fq.gz	FQ	7.09GB	df5c68334335e61f93950cc2bb4c1e45
V350296372_L03_read_2.fq.gz	FQ	16.06GB	034ce9f7660364bfd7649fdefde92d0e
V350296372_L04_read_1.fq.gz	FQ	7.29GB	2e78541d5d31fc1c18110f98693d6cb6
V350296372_L04_read_2.fq.gz	FQ	16.56GB	3e53ad800c66f0cd4af93468c6119da7
V350296374_L01_read_1.fq.gz	FQ	7.51GB	bd4e231a83f1529257ba347626e41266
V350296374_L01_read_2.fq.gz	FQ	17.06GB	8b4615a9fa827f816451cf7d918dac60
V350296374_L02_read_1.fq.gz	FQ	7.44GB	0b7999974fd0172a49da319c2ca883d1
V350296374_L02_read_2.fq.gz	FQ	17.00GB	a74eb7010891d0193b60b91b6549b478

输出及补充文件	格式	大小	md5sum
C04495G4_output_command_download	TXT	4.52KB	87798b128519333355f6131b286baaae
C04495G4.visualization.tar.gz	TAR	4.03GB	8d5b28cec3f58c56620b7400a9becd9f
C04495G4.report.html	HTML	51.04MB	a2208d70c3db22d38e38ad09422fb247
C04495G4.raw.gef	GEF	889.90MB	d5a784a173ddccf377b5cc679dce3859
C04495G4.tissue.gef	GEF	4.54GB	5671bec9e7f408b664c52b025f2bb9d9
C04495G4.tissue.gem.gz	GEM	286.15MB	9bf606d95efd861c720e6997cd62125d
C04495G4_HE_regist.tif	TIFF	957.22MB	cdf6bdb9d58e68af3a5a530f5a7f20cf
C04495G4.microorganism.raw.gef	GEF	1.81GB	6b4a292fdcceca9a8305b6cedf7ea31a
C04495G4_microorganism.class.gem	GEM	7.42MB	cf449a2d57a75f40bd3ac26427ddabe0
C04495G4_microorganism.family.gem	GEM	5.93MB	23fde94d569a532c08b291f8f138be98
C04495G4_microorganism.genus.gem	GEM	4.44MB	0077a0511fc828438eead4f3964d0315
C04495G4_microorganism.order.gem	GEM	6.16MB	fb5a1fc2da5f3c3284a1349d71e729fa
C04495G4_microorganism.phylum.gem	GEM	7.07MB	c7e45ce7f57351cfacc2c7d3d8700e38
C04495G4_microorganism.species.gem	GEM	4.29MB	bcdddc6f46d1e7d343f0df78acce3759

联系我们

即刻了解华大时空组学

咨询