小鼠肠演示数据 - 华大时空

登录注册

试剂盒版本号：Stereo-seq N FFPE V1.0，软件版本号：SAW 8.2 & StereoMap 4.2

时空转录组FFPE

小鼠肠演示数据

芯片号：Q00517FD

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：小鼠（品系：C57BL/6；性别：雄；年龄：6-8周）

组织类型：小肠

包埋方式：福尔马林固定石蜡包埋

DV200 ＞ 70%

试剂盒信息

产品方案：

时空转录组FFPE

试剂盒版本：Stereo-seq N FFPE V1.1

芯片尺寸：

1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：

5 μm

染色方案：

ssDNA染色

透化时间：

30 min

测序信息

Total reads：

1,313,745,902

测序仪：

MGISEQ-2000RS

分析结果

聚类图

输入文件输出及补充文件

输入文件	格式	大小	md5sum
Q00517FD_input_command_download	TXT	2.36 KB
Q00517FD.barcodeToPos.h5	H5	2.73GB	2ec0bd21adda16d0c6c5ee7af6135a7f
Q00517FD_manual_tissue_seg.tif	TIFF	1.02MB	705f9b928e392900812d42123e1c3a77
Q00517FD_SC_20250911_130712_4.2.0.tar.gz	TAR	230.75MB	3179c863941bf49306e785452ba95221
V350369279_L01_read_1.fq.gz	FQ	10.86GB	28147ebe8006b72099ae4b036f6fc015
V350369279_L01_read_2.fq.gz	FQ	13.29GB	ccedcbe167c57245363fa1a34fac7966
V350369279_L02_read_1.fq.gz	FQ	10.74GB	3e1ad785ac8b85630debd2722e8a45d1
V350369279_L02_read_2.fq.gz	FQ	12.90GB	a0117263125b3506f4b477f9d25afad4
V350369392_L01_read_1.fq.gz	FQ	11.92GB	d6190aa244d4f08d747eac159a900bdb
V350369392_L01_read_2.fq.gz	FQ	14.81GB	3f7ab132b3588c153ff1a48718039e4d

输出及补充文件	格式	大小	md5sum
Q00517FD.adjusted.cellbin.gef	GEF	1.44GB	4567921b7e8b8160bf76175c30a74897
Q00517FD.cellbin.gef	GEF	969.96MB	12615bfd9647fd2e2d959cecc92c96b2
Q00517FD.raw.gef	GEF	1.52GB	892f172f40fe3f1851a4d2b95261bcc2
Q00517FD.report.html	HTML	73.83MB	34b35808f4ff659f6ec9bac2c88dc453
Q00517FD_ssDNA_regist.tif	TIFF	177.07MB	754a2fc9e12a814d18381f9d581d0526
Q00517FD.tissue.gef	GEF	7.33GB	20956c7c3544bef6ae21a5c4566b2522
Q00517FD.visualization.tar.gz	TAR	6.05GB	bed8d2930a0eaa16d8581edcf8615d52
Q00517FD_output_command_download	TXT

联系我们

即刻了解华大时空组学