时空转录组+H&E染色_时空组学试剂_时空组学产品_STOmics

时空组学产品方案手册时空透化试剂套装（载体版兼容 H&E）使用说明书时空转录组试剂套装（载体版兼容 H&E）使用说明书

分子生物学与组织生物学的桥梁

时空组学技术 Stereo-seq结合H&E染色技术可在同一张切片上获得组织形态与时空转录组信息。根据H&E染色图像表征的病理信息，研究人员选取与特定科学问题相关的区域，提取对应表达矩阵，利用华大时空分析软件实现H&E图像与转录组表达矩阵的自动配准并进行下游高级分析，探索潜在分子机制。

Stereo-seq 兼容H&E染色的产品方案有助于更准确地利用组织分型及获取特定组织区域的基因表达信息，帮助研究者们更好地理解生命过程以及疾病发生和发展的分子机制，为疾病诊断、治疗、预后提供新思路。

产品亮点

高效的生化流程

在同一张切片上兼容转录组分析和H&E染色的同时，不会影响mRNA的捕获效率。

精准圈选兴趣区域

可直观便捷地根据H&E表征的病理信息圈选感兴趣区域，提取转录组表达矩阵进行多模态数据分析及探索。

纳米级分辨率

检测分辨率达到500 nm，可实现亚细胞级分子定位。

更广的时空视角

实现基因与组织影像同时分析，获得的分析结果可揭示疾病发生和发展的分子机制，为疾病诊断、治疗和预后提供新思路。

成果展示

演示数据

小鼠肾

样本类型：FF
染色方案：H&E染色
组织切片/组织面积：15.013 mm²
基因数：1,915（bin50）
每个细胞中位数转录本数量：655
芯片尺寸：1 cm × 1 cm

>>> 小鼠肾演示数据芯片号为C02533C1

立即探索可视化操作说明 >

选择最佳的透化条件，更利于mRNA捕获

在组织移除干净且保持同一成像条件的情况下，以组织形态完整，荧光值最强且无弥散为最佳透化条件的判断标准。以下鼠脑冠状面透化测试实验中，设置了3 min 、12min和24 min三个时间点，其中最佳的透化时间是12 min。

3 min

12 min

24 min

常见问答

Q 包埋过程应注意什么？展开收起

A

包埋过程中需注意取材尺寸 ( 目前要求组织块尺寸不得大于 0.9 cm x 0.9 cm x 2 cm)，选择合适尺寸的包埋盒。新鲜组织离体后需在 30 min内完成包埋，操作时应在低温环境下快速进行，避免 RNA 降解。包埋前应吸干组织表面水分，避免产生冰晶，同时也要避免 OCT 中气泡的产生影响后续切片。

Q 组织形态变型严重是何原因？展开收起

A

包埋过程中需注意取材尺寸 ( 目前要求组织块尺寸不得大于 0.9 cm x 0.9 cm x 2 cm)，选择合适尺寸的包埋盒。新鲜组织离体后需在 30 min内完成包埋，操作时应在低温环境下快速进行，避免 RNA 降解。包埋前应吸干组织表面水分，避免产生冰晶，同时也要避免 OCT 中气泡的产生影响后续切片。

Q 组织包埋块中冰晶过多如何避免？展开收起

A

包埋过程中需注意取材尺寸 ( 目前要求组织块尺寸不得大于 0.9 cm x 0.9 cm x 2 cm)，选择合适尺寸的包埋盒。新鲜组织离体后需在 30 min内完成包埋，操作时应在低温环境下快速进行，避免 RNA 降解。包埋前应吸干组织表面水分，避免产生冰晶，同时也要避免 OCT 中气泡的产生影响后续切片。

Q 组织包埋时，OCT 的量是否会对组织造成影响？展开收起

A

包埋过程中需注意取材尺寸 ( 目前要求组织块尺寸不得大于 0.9 cm x 0.9 cm x 2 cm)，选择合适尺寸的包埋盒。新鲜组织离体后需在 30 min内完成包埋，操作时应在低温环境下快速进行，避免 RNA 降解。包埋前应吸干组织表面水分，避免产生冰晶，同时也要避免 OCT 中气泡的产生影响后续切片。

2 Science 封面 | Stereo-seq构建全球 首个脑再生时空图谱

Science 封面 | Stereo-seq构建全球 首个脑再生时空图谱

Cell封面！Stereo-seq实现首次绘制 小鼠胚胎发育或器官的时空图谱

2 Science 封面 | Stereo-seq构建全球首个脑再生时空图谱

Science 封面 | Stereo-seq构建全球首个脑再生时空图谱

Cell封面！Stereo-seq实现首次绘制小鼠胚胎发育或器官的时空图谱