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时空转录组FFPE
全物种全转录组——探索无限可能
时空转录组FFPE V1.1可提供单细胞分辨率的Total RNA空间信息,以更高的捕获性能实现全物种全转录组空间表达图谱构建。
时空转录组FFPE
全物种全转录组——探索无限可能
时空转录组FFPE V1.1可提供单细胞分辨率的Total RNA空间信息,以更高的捕获性能实现全物种全转录组空间表达图谱构建。
时空转录组FFPE
全物种全转录组——探索无限可能
时空转录组FFPE V1.1可提供单细胞分辨率的Total RNA空间信息,以更高的捕获性能实现全物种全转录组空间表达图谱构建。
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产品介绍 产品亮点 应用创新 演示数据 操作流程 操作流程 产品订购信息
更高捕获精度与更精微的空间探索
时空转录组FFPE产品方案利用带有空间坐标信息的探针,对FFPE样本中组织细胞内的Total RNA分子进行原位捕获,并通过空间条形码 (Coordinate ID,CID) 还原回空间位置,从而实现全物种全转录组空间表达图谱的构建。为助力临床科研深入理解疾病的发生与发展机制,我们对该方案进行了全面升级。
升级后的时空转录组FFPE V1.1方案在保持Stereo-seq技术高分辨率的基础上,整体性能更优、稳定性更强。通过提升基因捕获效率、优化组织内外信号扩散、增强有效数据利用率,并支持多类型样本混测,该方案可帮助研究人员更高效地获取高质量数据,为在Cellbin水平深入探索肿瘤病理、感染性疾病机制等研究提供更强大的技术工具支持。
更高捕获精度与更精微的空间探索
产品亮点
捕获基因数显著提升
捕获基因数显著提升
以500 nm级分辨率实现无偏全转录组原位捕获,并凭借卓越的捕获性能,每个细胞可获得高水平的基因数,轻松实现Cellbin分析,精细解析基因表达空间特征。
高兼容性
高兼容性
- 适用于全物种FFPE样本;可兼容1 cmx1 cm和0.5 cmx0.5 cm芯片;
- 支持多类型样本混测:可在单张T7测序芯片上同步检测FF与FFPE样本来源的时空文库。
宿主和微生物共检测
宿主和微生物共检测
可同时捕获微生物及其宿主的空间表达信息,进而探究宿主与微生物的互作关系。
编码及非编码RNA共捕获
编码及非编码RNA共捕获
基于该产品的底层设计原理,可同时实现 mRNA 和 non-coding RNA的原位捕获。
演示数据
演示数据
鼠肠
  • 产品方案:时空转录组FFPE V1.1

  • 试剂盒版本:Stereo-seq N FFPE V1.1

  • 物种:小鼠

  • 组织类型:肠

  • 样本保存:福尔马林固定石蜡包埋

  • 染色方案:ssDNA染色

操作流程

样本准备
染色成像
mRNA捕获和cDNA合成
文库构建
测序
数据处理和可视化
样本准备

对组织样本进行冷冻、OCT包埋和切片(切片厚度一般为10 µm),并将其铺贴到芯片T

染色成像

组织切片固定后,对切片进行细胞核染色或H&E染色

染色后使用荧光显微镜进行拍照

mRNA捕获和cDNA合成

利用提前摸索好的最佳透化时间对组织切片透化处理后,细胞释放mRNA分子

具有空间坐标信息的探针可原位捕获细胞释放的mRNA,并进行逆转录获得cDNA

文库构建

对获得的cDNA产物进行扩增和纯化,构建全转录组文库。

测序

获得时空测序文库后,使用DNBSEQ系列高通量测序仪进行测序,获取样本序列信息。

数据处理和可视化

通过Stereo-seq Analysis Workflow (SAW)对空间基因表达数据进行处理,生成空间特征表达矩阵

利用StereoMap高清可视化软件实现交互式探索实验结果

产品订购信息
时空转录组FFPE V1.1 时空转录组FFPE V1.1 时空转录组FFPE V1.1
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