实测上新 | 派森诺实测数据揭秘时空转录组FFPE V1.1核心突破

2025.12.22 内容来源:华大时空

时空转录组FFPE V1.1产品方案于2025年9月焕新发布。派森诺生物作为华大时空重要生态合作伙伴,第一时间基于该产品方案启动独立实测验证并披露核心数据,解析技术突破内核。

升级后的FFPE V1.1方案,在数据产出质量、疑难样本兼容性上是否实现质的飞跃?能否破解长期困扰科研界的FFPE样本转录组研究难题?一起来看看派森诺生物的数据亮点吧。

/实测焦点:攻克FFPE样本“卡脖子”难题/

FFPE样本承载着关键生物学信息,但RNA片段化、核酸解交联等问题限制了空间转录组技术的应用。尤其值得关注的是,人淋巴瘤FFPE样本堪称该领域的“试金石”。其不仅肿瘤细胞异质性极强,还包含免疫细胞、基质细胞等构成的复杂肿瘤微环境,加之长期存档易导致核酸完整性受损,对技术的样本兼容性与数据捕获能力提出极高挑战。

派森诺于方案发布伊始,便依托标准化实验平台与疑难样本处理经验,完成该样本从前期处理到数据产出的全流程验证。

/核心数据:质量与分辨率双跃升/

本次实测采用1cm×1cm芯片规格,在2.48 G Total Reads测序深度下斩获超预期成果:Bin50层级平均MID数1732、平均基因检出数1143,全样本累计基因检出超3.6万个,低丰度基因捕获能力与数据均一性较首版显著提升。

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人淋巴瘤实测数据

借助华大CellBin算法,单细胞分辨率解析更实现突破——单个细胞平均MID数148、基因检出数128,可清晰勾勒各皮肤层级特异性基因表达谱,完美实现组织区域与单细胞分子特征的精准关联。

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人淋巴癌实测数据

/权威认证:彰显技术服务硬实力/

派森诺实测数据已通过华大时空FFPE实验数据质量认证。核心指标均远超基准要求,既印证了时空转录组FFPE V1.1方案的可靠性,也彰显了派森诺全流程标准化服务能力。深耕组学领域多年,派森诺积累了数千个前沿技术项目经验,此次协同验证进一步强化了其在FFPE样本研究领域的技术壁垒。

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有计划开展相关研究或深度解析珍贵FFPE样本,欢迎联系派森诺生物,获取量身定制的全流程科研支持。

未来,华大时空将持续深化与派森诺的合作,优化技术服务流程,推动空间转录组技术在多领域深度落地,助力科研工作者挖掘珍贵FFPE样本的科研价值。

/关于派森诺生物/

上海派森诺生物科技股份有限公司成立于2011年4月,是一家致力于为生命科学、健康医学等领域提供微生物组、基因组、转录组、单细胞及蛋白代谢等多组学分子生物学技术服务及大数据挖掘与分析服务的高新技术企业,是国家级专精特新“小巨人”企业、国家知识产权优势企业、上海市“科技小巨人”企业。公司总部位于上海,设有多家全资子公司,实验及办公面积逾15,000m2。

公司建立了完善的基因测序平台和大数据云计算平台,具有完全自主研发的创新技术和成果,派森诺生物及所属子公司已取得授权及受理专利、软件著作权250余项;合作项目论文多次发表在Nature、Lancet等国际生命科学、医学权威期刊,联合署名发表的SCI文章超6700篇,累计影响因子超过40000分。公司在全国31个省市设立了销售网点,业务网络覆盖亚洲、欧洲、大洋洲等多个国家,与全球500多所高校、300多家医院及600多家科研机构建立了紧密合作关系。

派森诺生物作为基因检测、蛋白代谢检测及大数据分析、体外诊断试剂开发的服务商,始终秉承“解析基因序列,诠释生命密码,改善人类生活”的企业使命,致力于为广大生命科学、医学工作者提供包括高通量基因测序、临床医学基因检测、蛋白及代谢组检测分析、生物信息学服务、生物云计算、分子生物学实验等科研及临床应用解决方案。

*内容转载自公众号:派森诺生物