小鼠脑演示数据 - 华大时空

时空转录组FF空间基因表达，小鼠脑（新鲜冷冻）

试剂盒版本号：Stereo-seq T FF V1.2，软件版本号：SAW 5.5 & StereoMap 1.0

时空转录组FF

小鼠脑演示数据

芯片号：SS200000135TL_D1

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：

小鼠（品系：C57BL/6；性别：雄；年龄：6-8周）

组织类型：

半脑

包埋方式：

新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定

RIN值：

8.0

试剂盒信息

产品方案：

时空转录组FF

试剂盒版本：

Stereo-seq T FF V1.2

芯片尺寸：

1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：

10 μm

染色方案：

ssDNA染色

透化时间：

12 min

测序信息

Total reads：

1,002,214,171

测序仪：

DNBSEQ-T7RS

分析结果

聚类图

分析软件版本：SAW 5.5，StereoMap 1.0
Bin200(100 µm) MID中位数：35,757
Bin200(100 µm) 基因中位数：6,726
每个细胞基因中位数：196
每个细胞MID中位数：335
测序饱和度：79.70%
组织覆盖率：83.06%
手动说明：该样本的cellbin结果经过手动调整和注释

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输入文件输出及补充文件

输入文件	格式	大小	md5sum
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输出及补充文件	格式	大小	md5sum
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