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时空转录组FF空间基因表达,小鼠舌(新鲜冷冻)

试剂盒版本号:Stereo-seq T FF V1.3,软件版本号:SAW 8.1 & StereoMap 4.1
小鼠舌演示数据
芯片号:B04372C214
样品信息
试剂盒信息
实验信息
测序信息
分析结果
染色图及原始数据下载
数据详情
样品信息
物种类型
小鼠(品系:C57BL/6;性别:雄;年龄:6-8周)
组织类型
包埋方式
新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定
RIN值
4.9
试剂盒信息
产品方案
时空转录组FF
试剂盒版本
Stereo-seq T FF V1.3
芯片尺寸
0.5 cm × 0.5 cm
实验信息
切片厚度
10 μm
染色方案
H&E染色
透化时间
12 min
测序信息
Total reads
1,184,524,188
测序仪
MGISEQ-2000RS
分析结果
小鼠舌演示数据 小鼠舌演示数据 小鼠舌演示数据
聚类图
  • 分析软件版本SAW 8.1,StereoMap 4.1
  • Bin200(100 µm) MID中位数113,966
  • Bin200(100 µm) 基因中位数11,790

  • 每个细胞基因中位数916
  • 每个细胞MID中位数1,698

  • 测序饱和度:73.50%
  • 组织覆盖率:81.46%
输入文件 输出及补充文件
输入文件 格式 大小 md5sum
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输出及补充文件 格式 大小 md5sum
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