小鼠脑演示数据 - 华大时空

时空转录组FF空间基因表达，小鼠脑（新鲜冷冻）

试剂盒版本号：Stereo-seq T FF V1.3，软件版本号：SAW 8.1 & StereoMap 4.0

时空转录组FF

小鼠脑演示数据

芯片号：C03937C4

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：

小鼠（品系：C57BL/6；性别：雄；年龄：6-8周）

组织类型：

半脑

包埋方式：

新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定

RIN值：

8.0

试剂盒信息

产品方案：

时空转录组FF

试剂盒版本：

Stereo-seq T FF V1.3

芯片尺寸：

1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：

10 μm

染色方案：

DAPI+mIF染色

透化时间：

12 min

测序信息

Total reads：

1,747,834,723

测序仪：

MGISEQ-2000RS

分析结果

聚类图

分析软件版本：SAW 8.1，StereoMap 4.0
Bin200(100 µm) MID中位数：44,309
Bin200(100 µm) 基因中位数：8,482
每个细胞基因中位数：732
每个细胞MID中位数：1,133
测序饱和度：79.30%
组织覆盖率：88.81%
手动说明：NeuN 和 SMI32 图像与 DAPI 图像之间的校准经过手动处理

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输入文件输出及补充文件

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