小鼠睾丸演示数据

时空转录组FF空间基因表达，小鼠睾丸（新鲜冷冻）

试剂盒版本号：Stereo-seq T FF V1.3，软件版本号：SAW 8.1 & StereoMap 4.1

时空转录组FF

小鼠睾丸演示数据

芯片号：B04652F6

样品信息

试剂盒信息

实验信息

测序信息

分析结果

染色图及原始数据下载

数据详情

样品信息

物种类型：

小鼠（品系：C57BL/6；性别：雄；年龄：6-8周）

组织类型：

睾丸

包埋方式：

新鲜组织OCT包埋切片去做甲醇固定

RIN值：

5.39

试剂盒信息

产品方案：

时空转录组FF

试剂盒版本：

Stereo-seq T FF V1.3

芯片尺寸：

1 cm × 1 cm

实验信息

切片厚度：

10 μm

染色方案：

DAPI+mIF染色

透化时间：

9 min

测序信息

Total reads：

406,753,020

测序仪：

MGISEQ-2000RS

分析结果

聚类图

分析软件版本：SAW 8.1，StereoMap 4.1
Bin200(100 µm) MID中位数：65,504
Bin200(100 µm) 基因中位数：10,225
每个细胞基因中位数：349
每个细胞基因中位数：410
测序饱和度：35.90%
组织覆盖率：83.26%
手动说明：组织分割经过手动处理

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输入文件输出及补充文件

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输出及补充文件	格式	大小	md5sum
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