2025.11.19 内容来源:华大时空
今年9月,时空转录组FFPE V1.1产品方案正式发布。这是继2024年6月首版方案发布后,华大时空在福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本领域取得的又一次重大突破。
时空转录组FFPE V1.1的实际数据表现如何?一起来看看华大时空生态合作伙伴美吉生物的实测结果吧。
/美吉生物实测数据展示/
时空转录组FFPE V1.1发布后,美吉生物立即对产品开展了测试。测试数据与官方demo数据对比显示,在FFPE样本数据分析关键指标上,包括有效数据利用率、有效CID及中位基因数等多个维度均实现大幅提升,其中有效数据利用率提高超过80%,单位面积中位基因数提升超160%。
测试结果体现了FFPE V1.1产品方案的显著优势,同时也展示了美吉生物稳定成熟的时空组学实验能力。详细数据如下。

FFPE V1.1 VS FFPE V1.0

/时空转录组FFPE V1.1升级亮点/
2024年6月华大发布了首版时空转录组FFPE产品方案,相关方法学文章已在Cell发表,点击查看>>>>Cell | 华大Stereo-seq实现宿主-微生物时空解析,破解FFPE难题
2025年9月发布的升级版时空转录组FFPE V1.1 产品方案,在保持编码&非编码RNA捕获,微生物捕获等性能的基础上,基因捕获效率相比上一版本提升50%-200%,高质量的数据产出更容易支持下游单细胞级别的高级分析。
新的测序建库流程与生信分析工具开发等方法将有效数据利用率提升了100%。让您在同样的测序深度下拿到2倍的有效数据量。同时,优化了组织内外信号的扩散情况,结合自研算法与软件可实现精准细胞级分析。
此外,时空转录组FFPE V1.1可稳定实现组织芯片蜡块(TMA)的高通量分析与多组织拼片。单张芯片可集成多个样本位点,或将不同穿刺位点的FFPE样本拼接至同一芯片,显著提升研究效率。
/美吉生物一站式组学无忧解决方案/
美吉生物一站式组学无忧解决方案定位于组学科研全场景,为科研人提供无忧做组学技能培训、数据挖掘云分析工具、组学资料等科研人常备技能和工具服务,为科研项目提供实验方案制定、样品制备、数据挖掘、结果交付等项目执行及解读服务,赋能科研人更好地驾驭科研项目,加速组学项目执行和成果产出。

美吉生物全线产品均已实现一站式组学无忧解决方案交付标准升级,产品包括微生物多样性、宏基因组、宏转录组、宏病毒组、微生物基因组、动植物重测序、转录组、原核转录组、small RNA、LncRNA、全转录组、单细胞组、空间转录组、代谢组、蛋白质组等多款产品。
*内容转载自公众号:美吉生物