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Nature Plants | Stereo-seq助力首次构建植物发育花芽时空转录组图谱并重建其细胞谱系

近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所杨学勇研究员团队，联合华大生命科学研究院等研究团队，在Nature Plants发表了题为“Developmental innovation of inferior ovaries and flower sex orchestrated by KNOX1 in cucurbits”的研究论文。该研究利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，首次构建植物发育花芽时空转录组图谱并重建其细胞谱系，揭示了黄瓜花居间分生组织活性驱动了花托加速生长，进而决定雌花发育与下位子房形成，同时提出了膨大花托是葫芦科植物单性花与下位子房形成的关键演化特征。

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Nat. Commun | 多样本时空组学数据联合分析工具重磅发布，更高效、更可靠！

4月21日，华大生命科学研究院在空间组学领域获得重大突破，研究团队首次提出了一套名为“Stereopy”的创新性分析框架，系统性地解决了多样本空间转录组数据联合分析的难题，为复杂生物系统的机制研究提供了全新工具。成果于Nature Communications发表。

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Neuron | Stereo-seq助力绘制鼠脑单细胞图谱，加速脑神经发育与疾病研究

近日，杭州华大生命科学研究院联合中国科学院脑科学与智能技术卓越中心、临港实验室和腾讯AI实验室等单位，利用单细胞转录组和时空组学技术Stereo-seq，构建了具有单细胞分辨率的成年小鼠大脑图谱，为大脑功能的理解提供了全新视角。相关成果在线发表于Neuron。

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Cell | Stereo-seq助力绘制迄今最完整植物单细胞图谱，揭秘叶片衰老的“资源转移战”

4月11日，武汉华大生命科学研究院联合华大生命科学研究院基因组多维解析技术全国重点实验室、南方科技大学等单位，利用华大自主研发的单细胞组学技术DNBelab C4和时空组学技术Stereo-seq，在单细胞水平上成功解密了拟南芥叶片衰老的过程，相关研究成果发表于国际顶级学术期刊《细胞》（Cell）。

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Nat Commun | Stereo-seq助力绘制乳腺癌空间图谱，揭示免疫浸润的微静脉调节机制

2025年4月9日，中国医学科学院肿瘤医院联合三亚华大生命科学研究院，在国际知名学术期刊Nature Communications发表了乳腺癌空间转录组学研究最新成果。研究人员利用华大自主研发的单细胞转录组平台DNBeLab C4和时空组学技术Stereo-seq，首次构建了全面的乳腺癌高分辨率空间转录组图谱，精细刻画了肿瘤血管系统表型与空间的异质性，并突破性地揭示了由微静脉内皮细胞和微静脉平滑肌细胞共同构建的“小静脉生态位” (venular niche) 通过趋化因子信号协同调控淋巴细胞浸润肿瘤的关键机制，为开发增强乳腺癌免疫治疗疗效的新策略提供了重要靶点和理论依据。

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Molecular Plant | Stereo-seq助力解析陆稻根系适应干旱的分子机制

近日，华大生命科学研究院联合华中农业大学利用华大自主研发的Stereo-seq时空组学技术，系统性地解析了陆稻根系适应干旱的分子机制，并鉴定出关键调控基因HMGB1，为作物抗旱遗传改良提供了新思路。成果发表于Molecular Plant。

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Cell | Stereo-seq助力绘制全球首个猕猴屏状核多模态图谱，揭秘意识关键脑区

2025年4月3日，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、华大生命科学研究院、法国国家卫生与医学研究院干细胞与脑研究所、临港实验室、上海脑科学与类脑研究中心、腾讯生命科学实验室等机构共同发布了全球首个非人灵长类屏状核多模态图谱，结合单细胞组、时空组和联接组等多组学数据，揭示了猕猴与啮齿类动物的屏状核结构、细胞类型和分布存在显著性差异，首次证实了屏状核不同功能区内富含特异的神经元，为理解人类意识产生的进化机制提供了新的研究思路，也为语言、精神类疾病的研究和治疗提供了潜在的靶点。相关研究发表于国际顶级学术期刊《细胞》（Cell)。

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Cancer Cell | Stereo-seq助力首次绘制肝细胞癌中TLS的全景发育图谱

近日，中山大学附属第一医院肝胆胰外科中心、精准医学研究院，中山大学中山医学院、华大生命科学研究院等团队，联合利用华大自主研发的高分辨率时空组学技术Stereo-seq，首次绘制出肝细胞癌中TLS的全景发育图谱。该研究不仅详细描绘了TLS在调控抗肿瘤免疫及免疫治疗反应中的独特特征，更首次揭示了色氨酸代谢在TLS成熟过程中的关键调控作用，为肝细胞癌及其它癌症的早期诊断和新型免疫治疗方案的开发提供重要参考。相关成果发表于国际学术期刊《癌细胞》（Cancer Cell）。

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Neuron | Stereo-seq助力绘制全球首个阿尔茨海默病海马单细胞分辨率时空图谱

近日，杭州华大生命科学研究院联合浙江大学医学院第一附属医院、浙江大学国家健康与疾病人脑资源库等单位，利用华大自主研发的单细胞转录组和时空组学技术Stereo-seq，成功绘制了全球首个阿尔茨海默病（AD）患者海马体的单细胞分辨率“时空图谱”，相关成果已在《Neuron》期刊上发表，并荣登Cell出版社头条推荐。这一成果不仅加深了对AD发病机制的理解，还为临床早期诊断提供了潜在的新生物标志物。

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超牛算法！从Cell封面到Nature，Stereo-seq助力西湖大学定位抑郁症“藏身之处”

2025年3月19日，西湖大学杨剑团队最新研究在Nature发表。研究人员通过一种名为gsMap的技术，首次绘制出人类复杂疾病相关的大脑细胞“空间地图”，揭示了精神分裂症、抑郁症等疾病的细胞空间分布特征，为脑疾病机制研究和精准治疗提供了新工具。值得一提的是，为了验证gsMap的有效性，研究人员采用了基于华大时空组学技术Stereo-seq生成的小鼠数据集，成功复现了不同器官与性状间的已知关联，并带来了一系列疾病关联细胞的空间定位革命。

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