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Cancer Cell | Stereo-seq助力首次绘制肝细胞癌中TLS的全景发育图谱

近日，中山大学附属第一医院肝胆胰外科中心、精准医学研究院，中山大学中山医学院、华大生命科学研究院等团队，联合利用华大自主研发的高分辨率时空组学技术Stereo-seq，首次绘制出肝细胞癌中TLS的全景发育图谱。该研究不仅详细描绘了TLS在调控抗肿瘤免疫及免疫治疗反应中的独特特征，更首次揭示了色氨酸代谢在TLS成熟过程中的关键调控作用，为肝细胞癌及其它癌症的早期诊断和新型免疫治疗方案的开发提供重要参考。相关成果发表于国际学术期刊《癌细胞》（Cancer Cell）。

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Neuron | Stereo-seq助力绘制全球首个阿尔茨海默病海马单细胞分辨率时空图谱

近日，杭州华大生命科学研究院联合浙江大学医学院第一附属医院、浙江大学国家健康与疾病人脑资源库等单位，利用华大自主研发的单细胞转录组和时空组学技术Stereo-seq，成功绘制了全球首个阿尔茨海默病（AD）患者海马体的单细胞分辨率“时空图谱”，相关成果已在《Neuron》期刊上发表，并荣登Cell出版社头条推荐。这一成果不仅加深了对AD发病机制的理解，还为临床早期诊断提供了潜在的新生物标志物。

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超牛算法！从Cell封面到Nature，Stereo-seq助力西湖大学定位抑郁症“藏身之处”

2025年3月19日，西湖大学杨剑团队最新研究在Nature发表。研究人员通过一种名为gsMap的技术，首次绘制出人类复杂疾病相关的大脑细胞“空间地图”，揭示了精神分裂症、抑郁症等疾病的细胞空间分布特征，为脑疾病机制研究和精准治疗提供了新工具。值得一提的是，为了验证gsMap的有效性，研究人员采用了基于华大时空组学技术Stereo-seq生成的小鼠数据集，成功复现了不同器官与性状间的已知关联，并带来了一系列疾病关联细胞的空间定位革命。

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单细胞+空间组学破解“儿童肿瘤之王”免疫抑制之谜：CD112/CD155异质表达，影响γδT细胞肿瘤杀伤活性

近日，国家儿童医学中心/首都医科大学附属北京儿童医院/北京市儿科研究所倪鑫/桂晋刚教授团队在《Cancer Research》发表题为“Spatial and Single Cell Analyses Reveal Heterogeneity of DNAM-1 Receptor-Ligand Interactions that Instructs Intratumoral γδT-Cell Activity”的研究论文。

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Mol. Plant | Stereo-seq助力绘制首个国产大豆的全生命周期器官发育“时空图谱”

近日，中国科学院遗传发育所携手华大生命科学研究院、崖州湾国家实验室和中国科学院基因组研究所等单位，基于华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq等，成功绘制了首个国产大豆的全生命周期器官发育“时空图谱”，相关成果发表于国际权威期刊《分子植物》（Molecular Plant）。该研究首次实现了大豆基因表达在发育阶段、细胞类型和空间定位的精准解析，为破解大豆器官发育机制提供了里程碑式资源。

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iMeta | 肠道微生物“缺席”引发免疫代谢紊乱？Stereo-seq来解谜

2025年2月14日，华大生命科学研究院方晓东、康美华大韩丽娟、哥本哈根大学Kristiansen Karsten、华中农业大学魏泓等在iMeta发表了肠道微生物相关研究。在本研究中，科研人员利用单细胞RNA测序技术（scRNA - seq）、华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，以及靶向胆汁酸代谢的组学手段，对无菌小鼠和无特定病原体小鼠的不同组织器官展开了全方位的多组学数据大对比。

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Adv. Sci | 从“奋斗”到“躺平”？Stereo-seq助力揭示肝脏应对“虫癌”的免疫应答机制

近日，北京华大生命科学研究院联合中国农业科学院兰州兽医研究所和兰州大学在Advanced Science发表研究成果，利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，首次绘制了高分辨率的多房棘球蚴（即多房棘球绦虫幼虫期）感染小鼠肝脏的时空动态图谱。

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Cell Discovery | 肝癌治疗新曙光！Stereo-seq助力首次绘制两种不同类型肝细胞癌的“城市地图”

近日，华大联合复旦大学附属中山医院、中国科学院神经科学研究所等团队，在Cell Discovery发表肝细胞癌相关研究。研究利用图像深度学习、空间蛋白质组学、华大时空组学技术Stereo-seq，以及单细胞/细胞核RNA测序等技术，首次解析了两种不同基质模型的肝细胞癌（HCC）——纤维环阳性肝细胞癌（FR+ HCC）和纤维环阴性肝细胞癌（FR- HCC）的基质蛋白分子及细胞组成的空间图谱。

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STTT | 熬夜引发致命“免疫风暴”？Stereo-seq助力揭秘暴发性心肌炎幕后黑手并探索潜在疗法

北京时间2025年2月10日，华中科技大学附属同济医院与华大生命科学研究院合作在Signal Transduction and Targeted Therapy上发表了一项关于暴发性心肌炎最新研究成果。该研究结合了华大时空组学（Stereo-seq）技术和单核RNA测序（snRNA-seq）技术，在CVB3病毒感染的小鼠模型中绘制出FM时空动态基因图谱。

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Cell子刊！华大开发新算法，为组织发育和疾病研究提供重要支撑

北京时间2月4日，西南华大生命科学研究院科研团队成功开发了推断细胞时空分化轨迹的新算法SpaTrack，相关成果在线发表于Cell旗下子刊Cell Systems。该算法可充分整合细胞的转录组和空间信息，构建细胞分化的动态轨迹，为揭示组织发育、器官再生和疾病进展的动态研究提供了有效的方法支持与重要见解。

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