实测上新 | 安诺优达时空转录组FFPE V1.1实测数据卷出新高度

2025.12.05 内容来源:华大时空

今年9月,华大时空转录组FFPE V1.1产品方案正式发布。这是继2024年6月首版方案发布后,华大时空在福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本领域取得的又一次重大突破。

时空转录组FFPE V1.1的实际数据表现如何?一起来看看华大时空生态合作伙伴安诺优达的实测结果吧。

/安诺优达实测数据展示/

时空转录组FFPE V1.1发布后,安诺优达采用鼠肾脏FFPE样本进行了全流程测试,各项数据表现优秀,为FFPE样本的深层次研究提供了更具性价比的解决方案。 

01. 数据有效利用,测序不浪费 

在3G Total Reads的测序数据量下,有效CID序列占比达79.5%(2.38 G),为后续分析提供了高利用率的有效数据基础。

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在25µm(bin 50)的经典分析尺度下,平均分子数为5,941,检测基因总数达29,611,平均基因数达2,303,展示出优异的基因覆盖与信号深度,为深入的生物学挖掘提供了高质量信息。 

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安诺优达实测-Square bin结果展示

03. 多尺度分析灵活,准确解析异质性 

基于合并单元格(bin)的分析策略,Square bin提供灵活分辨率选择,在bin 20(10µm,约一个细胞大小)的高分辨率下,成功划分出25个细胞亚群,细胞异质性的“细节” 清晰可见。

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安诺优达实测-bin20 空间聚类结果展示

04. 单细胞级洞察,空间表达更准确 

通过Cell bin(基于细胞影像图+算法自动分割)分析,共获得185,603个细胞,单细胞基因中位数达583,实现了接近单细胞水平空间表达谱,基因表达的空间特征更高清。

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安诺优达实测-Cell bin空间聚类结果展示

从本次测试的整体流程和数据来看,产出稳定且数据质量十分亮眼。该技术已成功测试多物种多组织样本,从致密器官到复杂组织类型,在不同样本背景下均保持基因捕获效率高、空间定位准确的优势。

安诺优达目前已产出1000+张STO芯片数据,积累了丰富的空间组学实验及分析经验,将持续为您的空转实验保驾护航。

/限时福利/

2025年12月31日前,通过华大时空组学生态合作伙伴安诺优达签订Stereo-seq FFPE V1.1可享早鸟优惠!实验不踩坑,结果有保障,快来联系安诺优达吧,解锁更多可能!

/关于安诺优达/

安诺优达作为国内单细胞空间测序的探索者,历经十余年的NGS和TGS深厚积累,提供覆盖单细胞空间多组学专业服务。目前已积累50+物种的各类组织单细胞样本处理经验,以及60+空间组织经验,建立了完善的个性化数据挖掘分析体系,可为生命科学研究提供从样本处理到数据深入挖掘的全程解决方案。

*内容转载自公众号:安诺基因