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交互分析-图像分析
【新增】“图像分析”增加线上手动“细胞分割”模块
时空组学的图像分析主要包含图像 QC、图像校准、图像拼接、组织分割和细胞分割五个模块,支持用户手动调整拼接和分割的 Mask,满足不同场景下的用户需求。细胞分割模块,主要基于图像预处理后的数据,提供手动圈选细胞 Mask 的功能。支持 ssDNA、DAPI 和 DAPI&mIF 三种不同染色类型的手动组织分割,并适配 2*3 大芯片。
备注:其中组织分割和细胞分割模块已上线,其它三个模块正在开发中,后期会陆续上线。
1)点击“图像分析”,进入图像分析对应的各个子模块。

2)点击“打开”,选择需要手动操作的 IPR+TAR.GZ 文件。


3)若是"ssDNA/DAPI",点击“确认”,系统基于打开的文件生成底图或者细胞 Mask,是否生成细胞 Mask页面取决于用户输入的IPR文件中是否做过细胞分割。

4) 若是DAPI&mIF,点击“确认”。系统基于打开的文件生成DAPI底图或者细胞 Mask页面,是否生成细胞Mask页面取决于用户输入的IPR文件中是否做过细胞分割。

5) 用户可在Tab页签勾选要打开其他蛋白底图和对应的Mask页面,比如选择TESK2。

6) 用户可根据实际情况,选择矩形、多边形、画笔和橡皮擦等工具,手动调整细胞 Mask。