v2.8.0 版本更新公告
注册/登录
【优化】UI优化
【新增】站点切换入口
点击可进行站点切换，跳转到海外其他云平台站点。
首页
【优化】UI优化：最近项目、最近任务
点击最近项目的“更多”进入项目管理页面；
【新增】常用功能入口
点击“新建项目”进入新建项目页面；
点击“demo项目“进入时空demo项目”stomics demo case"详情页；
点击“新建Notebook"进入选择已有项目创建notebook；
点击”Genpilot"进入对应页面；
【新增】任务统计和存储统计
查看用户有权限项目的任务统计和存储资源使用统计；
【新增】帮助中心入口
点击箭头位置进入【帮助中心】模块首页；
点击红框内的单个问题，快捷跳转到问题对应帮助中心文档处；
【新增】公共资源入口
显示公共项目，公共应用和公共数据三个模块的一句话介绍和各模块的数据量；
点击查看，进入对应的页面；公共数据页面正在开发中，暂不提供查看；
项目概述
【优化】整合项目信息编辑，查看，删除入口
功能逻辑不变，只是入口整合到此处，按不同的项目角色权限可查看、编辑和删除项目；
【新增】项目描述功能
项目描述默认显示欢迎语，及6个项目常用功能的帮助中心入口；
点击入口，进入对应帮助中心的页面，指导用户快速开展项目；
点击编辑，可编辑项目描述，保存后，项目描述模块显示用户保存后的信息；
【优化】项目成员管理入口
数据管理
文件
【新增】添加文件-从其他项目中复制
该功能用于让用户从云平台公共项目，或有权限其他项目中复制文件或文件夹。
在文件页面，点击按钮【添加文件-项目复制】后进入项目复制界面，在该界面选择你需要复制的文件或文件夹后，点击按钮【复制到项目】，在弹框中点【确认】即可。
【新增】添加文件-使用工具上传文件
该功能用于让用户通过ossutil工具，或镭速工具将本地大文件上传至云平台。
在文件页面，点击【添加文件】按钮，选择【工具上传】即可进入工具上传界面。若是阿里云片区，界面则显示ossutil工具相关信息，若是深圳片区，界面则显示的是镭速工具信息。
1.ossutil工具上传
仅阿里云片区有此功能，利用该工具直接将本地文件或文件夹通过命令的方式，上传至阿里云oss桶。使用ossutil工具上传的操作步骤如下：
1）下载ossutil工具（第一次使用ossutil工具时）；
2）解压上述文件，解压后双击打开ossutil工具，进入命令提示符界面；
3）在云平台ossutil工具上传界面，点击按钮【生成上传命令】，复制命令并粘贴到命令提示符界面；
4）将命令中的 *Your File Path*改为本地需要上传的文件或文件夹路径（若上传的是文件，则需写以文件格式结尾的全路径），点击回车即可完成上传。
举例如下：
1）将1个文件上传到云平台项目中
若需要同时传多个文件，则需粘贴多次命令，即每个文件一条完整的命令。
2）将1个文件夹上传到云平台
3）若需要同时传多个文件夹，则需粘贴多次命令，即每个文件夹一条完整的命令
2.镭速工具上传
仅深圳片区有此功能，利用镭速客户端选择本地需要上传的文件后，通过镭速服务器上传至云平台深圳华大存储。使用镭速上传操作步骤如下：
1）下载镭速客户端（第一次使用镭速时），并打开镭速客户端；
2）点击按钮【立即上传】，在弹出框中选择文件或文件夹（可按住Ctrl选中多个文件）后，点击按钮【ok】即可。
**注意：**镭速客户端显示上传完成后，云平台后台还需从镭速拷贝文件到深圳华大存储，这个过程根据文件大小持续几分钟到几小时不等。故镭速完成传输完成后系统页面无法立即查看，建议100M的小文件用本地电脑-网页传输方式。
【新增】下载-阿里云网页下载
仅阿里云片区有此功能，用于让用户通过浏览器方式将阿里云的文件下载到用户本地。
在文件管理页面，选择1个或多个需要下载的文件，点击按钮【下载-网页下载】即可将所需文件下载到本地设备。
【新增】下载-阿里云工具下载
仅阿里云片区有此功能，用于让用户通过Ossutil工具的方式将阿里云的文件或文件夹下载到本地。操作步骤如下：
1）下载ossutil工具（第一次使用ossutil工具时）文件；
2）解压上述文件，解压后双击打开ossutil工具，进入命令提示符界面；
3）在云平台文件页面选择需要下载的文件后，点击按钮【下载-工具下载】，将弹框中的命令复制粘贴到Ossutil工具命令提示符后，将命令中的*Your Folder Path*修改为本地存放文件的文件夹路径，点击回车即可。
**注意：**批量下载多个文件或文件夹时，每个文件或文件夹的命令需要单独复制（即每个文件或文件夹复制粘贴一次）。或者一次性复制到本地txt中统一修改*Your Folder Path*后，再一次性复制复制到oss工具命令提示符界面。
【新增】复制文件路径
用于复制文件路径，以便更好的填写表格。
在文件页面，鼠标移入到需要复制路径的文件名称处，点击按钮
即可复制以文件格式结尾的全路径。
【优化】各个界面样式调整
文件模块按照云平台整体风格样式，整其配色、字体、表单间距、弹框尺寸等样式。
表格
【新增】删除整个表格
用于让用户删除一次性整个表格。
在数据管理-表格页面，鼠标移入到需要删除的表格处，点击按钮
，则会删除整个表格。
注意：删除后无法再恢复，请谨慎操作。
【新增】在已有表格中新增数据
用于让用户在已有的表格中，持续新增数据。
在数据管理-表格页面，点击左侧需要新增数据的表格，点击右上角按钮【新增数据】，在弹出框中下载模板并在模板中填写信息后，导入此模板。
【新增】删除表格中的部分数据
用于删除表格中的部分数据。
在数据管理-表格页面，点击左侧需要删除数据的表格，勾选需要删除的数据后，点击按钮【删除】，在弹出框中点击按钮【确定】，则所选数据将会被删除。
**注意：**删除后无法再恢复，请谨慎操作。
【新增】下载表格中的部分数据
用于下载表格中的部分数据。
在数据管理-表格页面，点击左侧需要下载数据的表格，勾选需要下载的数据后，点击按钮【下载】，则会将Excel的文件下载到本地。
【优化】各个页面样式调整
表格模块按照云平台整个风格样式调整其配色、字体、表单间距、弹框尺寸等样式。
流程分析
【优化】工作流工具管理逻辑
该功能用于调整工作流、工具与公共库或项目之间的交互逻辑，与平台其他模块交互更统一。
页面去掉“项目工作流”、“引用工作流”分类，工作流都展示在项目内（工具同理）
操作栏去掉授权功能（工具同理）
分享公共库调整为发布，当用户发布流程后，字段变更为“更新发布”
【新增】从公共库复制工作流
改功能用于方便用户直接在项目内可复制工作流，减少交互操作
鼠标悬浮【新建工作流】按钮，弹出下拉框，分为从公共库中复制，新建工作流，点击【从公共库复制】按钮进入公共库流程展示界面，点击复制按钮即可添加到项目内
【新增】自定义标签、官方标签
该功能用于方便用户通过工具卡片标签快速知道工具信息。
1、自定义标签：创建或编辑工作流时，流新增标记标签功能，为输入选择框，点击标签框，展示系统提供的默认标签：SAW、SCRAN、ATAC，若系统标签不满足，可手动输入，支持存在多个标签（上限5个），点击标签卡片【×】，删除标签
2、官方标签：新增配置“标记为官方流程”，该设置仅平台管理员可设置，勾选则对应工作流卡片展示为【STO】，
【新增】WDL是否公开配置
该功能用于生信工程师维护WDL代码项目内是否可见。
创建或编辑工作流时，新增配置“是否公开WDL”，默认为勾选公开，当公开时，在工作流详情页面可查看WDL代码，不公开则详情页不可见
【新增】复制流程可更新
该功能用于分析人员可持续从公共库中获取最新的流程。
用户从公共库或者其余项目复制流程到本项目内时，当公共库或项目内流程更新，在本项目内会显示【更新】标记
点击更新按钮后，将获取公共库的最新工作流覆盖在项目内
注：当编辑工作流后，工作流将完全属于项目内的个人工作流，会停止接收更新消息
【优化】任务详情
任务详情页新增编辑、运行、删除、发布、复制操作，操作逻辑与卡片交互一致，方便用户在查看详情时可操作工作流，无需返回工作流列表
【优化】任务运行
该功能主要用于优化任务投递的易用性。
运行界面优化为按照步骤条展示，第一步为：查看任务信息及选择参数输入方式；第二步为：参数输入；第三步为输出设置
- 第一步查看任务信息、选择参数输入方式，新增选择任务、参数输入方式
--参数输入方式分为：表格数据输入、运行界面输入，默认勾选运行界面输入，当切换至“表格数据输入方式”，出现“选择表格”及下拉框交互
--选择表格后在界面显示表格数据，支持多选，翻页选择
注：
当该流程为串联工作流，“工作流”除显示对应工作流名称外，会显示【官方】及【串联流程】标签，
当该流程为串联工作流，在运行界面输入模式下增加选择任务及下拉框并提示，点击下拉框显示任务数据表格，任务ID为本流程在后台配置的上游流程产生的任务数据，暂只支持单选；勾选“表格数据输入”时，无下拉框展示
- 在第一步界面点击【下一步】按钮，进入第二步：输入设置
--点击【任务预览】按钮展示每条任务的参数取值，在任务预览界面可以修改每条任务的取值
--点击【上一步】按钮回到第一步
注：
- 当该流程为串联流程，且在第一步已选择任务ID，则输入设置可根据任务ID及流程配置关系在输入设置界面将参数取值自动填充
- 点击第二步【下一步】按钮进入第三步：提交任务
【新增】工具箱配置
该功能用于配置工具箱，方便设置工作流上下游的串联关系
1、在流程分析模块新增tab页-工具箱配置
展示流程配置表，包含工具箱名称、是否生效、创建人、创建时间、配置流程图、描述
支持流程配置表根据配置名称、流程名称、状态（生效、关闭）搜索
【查看详情】进入配置页面，只可查看
【新建配置】进入配置编辑页面
点击【编辑】进入配置编辑页面
- 点击【新建配置】按钮，进入工具箱配置界面工具箱名称、生效开关、串联规则设置、详细信息
工具箱名称必填且平台内唯一，
生效开关新建时默认开启，允许手动关闭，开启后配置生效可在流程卡片展示对应的串联标记，关闭则配置不生效，前台将隐藏工具箱
设置流程配置规则
--默认提供两个流程环节，点击“+”号，添加流程环节
--点击流程框，下拉展示选择流程版本，确定串联环节所用到的流程版
--确定指定流程版本后，展示对应的参数，点击“匹配上游流程参数”显示串联流程里该留的所有上游流程，切换不同的流程，展示不同流程的input、output，
--点击output下的参数表示参数与参数关联，点击“output”节点，表示参数关联结果目录
--按需为输入参数逐一设置关联上游的输入或输出参数
--点击保存后，则工具箱配置生效，在流程运行界面可以通过参数匹配的规则推荐参数
【新增】工具箱管理
该功能用于展示配置的串联工作流。
流程分析模块新增工具箱管理tab
当管理员在“工具箱配置”模块设置好流程串联规则并启动生效，在工具箱界面展示对应的工具箱信息，工具箱名称对应工具箱配置的名称。
工具箱支持从公共库复制、复制、发布、删除
点击工具箱，展示工具箱详情，即工具箱中包含的流程，支持对单个流程直接运行
交互分析
图像分析
交互分析包括图像分析、高级分析和可视化三个模块，满足不同用户的需求。
【新增】“图像分析”增加线上手动“图像拼接”模块
时空组学的图像分析主要包含图像 QC、图像校准、图像拼接、组织分割和细胞分割五个模块，支持用户手动调整拼接和分割的 Mask，满足不同场景下的用户需求。图像拼接模块，主要用于手动调整显微镜小图的拼接效果。主要分为基于track线模板和图像重叠区域的手动调节。支持 ssDNA、DAPI 和 DAPI&mIF 三种不同染色类型的手动图像，并适配 2*3 大芯片。
- 点击“图像分析”，进入图像分析对应的各个子模块。
- 点击“打开”，选择需要手动操作的 IPR+TAR.GZ 文件。
- 点击“确认”，选择拼接方法，根据数据展示适配的拼接方法并用黄色高亮。
若是选择的“track线拼接”。
- 系统会基于打开的IPR文件（记录QC模块检测出的每张小图FOV的track线交叉点信息）以及小图TAR.GZ文件，生成一张局部大图。界面中的每个小方块展示每个FOV小图中track线交点的局部图，并根据小图行列号拼成局部大图。
- 首先查看 M标记的FOV 看是否跟 Track 线对齐。双击局部大图标记M的FOV或者单击左侧FOV的列表打开。
- 如果没有对齐，点击“M”图标修改 track 网格线。
- 其次查看非模板FOV调节看是否有新增或者修改的 track 点。双击带有红色X或者红色o的小图FOV，进入调节非模板FOV的位置。
- 调节图像增强，找到一个清晰的十字track点，点击“+”图标，图上会出现一个绿色圆圈，鼠标移动到该点上，出现小手状态，可拖动此点移至实际track线交点位置，移动过程中绿色圆圈会变为红色十字线，以便于与track线比较。
若是全部为已确认的FOV，点击“运行”程序会根据手动标记的局部拼接大图中的每个手动选中的track交点坐标点的位置重新拼接。
若是选择的“无track线拼接”
系统会基于打开的IPR文件（记录QC模块检测出的每张小图FOV的track线交叉点信息）以及小图TAR.GZ文件，生成一张拼接后的全局大图。界面中的每个小方块代表每个FOV，并根据小图行列号拼成一张全局大图。
- 拖动“拼接误差调节”，全局大图中将展示算法检测到大于该误差的FOV并标记为红色。设置的误差越小，全局大图中红色的FOV越多。
- 双击全局大图中红色的FOV或者单击左侧FOV的列表打开。
- 生成一张九宫格的小图，调节图像增强后，可在右侧“拼接调节”中移动圆盘或者键盘的上下左右方向键调节FOV的位置。根据OverLap的分数或者颜色的重合程度（黄色）来判断。
- 全图FOV调整完毕后点击“运行”，程序会根据手动移动的FOV重新拼接新的大图。
【新增】“图像分析”增加线上手动“图像校准”模块
时空组学的图像分析主要包含图像 QC、图像校准、图像拼接、组织分割和细胞分割五个模块，支持用户手动调整拼接和分割的 Mask，满足不同场景下的用户需求。图像校准模块，主要用于蛋白与DAPI的校准，手动调节蛋白图层，在形态学上尽量跟DAPI图层重合。支持在水平、垂直方向、小角度和小尺度的调节。支持的染色类型为 DAPI&mIF。
- 点击“图像分析”，进入图像分析对应的各个子模块。
- 点击“打开”，选择需要手动操作的 IPR+TAR.GZ 文件。
- 选择待手动分割的文件（IPR+TAR.GZ）界面。
- 点击“确认”系统基于打开的文件生成DAPI和蛋白的页面。
在蛋白页面：
- 点击“校准调节”面板的中心可以设置调节的步长。
- 点击“校准调节”面板的上下左右键，在水平和垂直方向调整蛋白的位置。
- 点击"角度调节"和“尺度调节”，小角度和尺度调整蛋白图层的缩放和旋转角度。
注意：
用户可根据需要输入步长，默认“校准调节”的步长为1像素。
用户可点击键盘的上下左右键在水平和垂直方向移动蛋白的位置。
- 所有蛋白都调整完成后，点击“保存”，修改后的参数将会写入 IPR 文件中。
高级分析
【新增】支持从数据管理选择gef文件
用户可自行上传gef文件至数据管理，在高级分析模块中选择数据管理中的任意gef文件进行分析。
【新增】PT增加分群选择参数
支持用户选择部分分群进行拟时序分析。
【新增】增加binsize 30~90的选项
目前支持bin 20-90, 100, 200, 500。
【新增】文件整合功能
所选的报告模块所生成的结果（除h5ad文件外），将全部整合到数据管理模块的下述路径中，方便用户快速整理与交付。
【优化】优化h5ad文件大小
此版本中大幅精简了h5ad的文件大小。
【优化】功能富集网络连接图样式优化
调整了字体大小及线条粗细。
可视化
【新增】增加“测量”小工具，可以测量两点间的距离。
- 点击“测距”小工具。
- 测量两点之间距离。
【新增】比例尺增加 binsize
【优化】可视化工具缺省页和打开界面优化
镜像管理
镜像管理入口移动到项目管理模块，不同项目内个人所拥有的自定义镜像和公共镜像保持一致，使用逻辑保持不变。
公共库
【新增】公共项目-复制功能
新增公共项目模块，用户可将公共项目复制为自己的个人项目；
复制成个人项目后，复制人成为个人项目的项目负责人，可以在新项目里投递任务；
【新增】公共应用-合并Workflow/Tool、Notebook类型的工具
用户发布的Workflow/Tool、Notebook类型工具，均合并在“公共应用”模块。
【新增】公共应用-搜索、筛选、排序功能
搜索：支持对标题、贡献者进行模糊搜索。
筛选：支持根据工具类型、应用/应用工具箱、标签进行筛选。
排序：支持对更新时间、引用数、点赞数进行升序/降序排列。
【新增】公共应用-点赞功能
支持用户对应用/应用工具箱点赞或取消点赞。
【新增】公共应用-新增应用工具箱
workflow串联流程可发布为应用工具箱，工具箱详情页可查看其所包含的应用列表。
点击应用列表内的单个应用卡片即可查看应用详情。
计费管理
【新增】新建项目时，需要选择项目关联哪个计费组
下拉框里显示当前用户的所有计费组；
【新增】个人中心新增计费组入口
点击计费组，进入当前户的计费组列表页
【新增】查看用户所有计费组列表
查看当前用户所有的计费组列表，包括我作为所有者的计费组和作为使用者的计费组
也可以邮件平台管理员，新建计费组；
已有项目按规则生成计费组名称，项目负责人默认为计费组的所有者；
点击计费组名称，进入到计费组详情页
【新增】查看计费组详情，包括计费组关联的项目、管理计费组成员，查看费用账单
用户可以查看当前计费组为哪些项目支付费用
计费组的所有者可以管理计费在组的成员，包括新增计费组的成员、编辑成员角色，删除成员等；
计费组的使用者，只能查看当前计费组的所有者列表，看不到使用者；
只有计费组的所有者才能看到“费用账单”模块；使用者无此入口；
切换不同的月份，查看月度账单汇总概览，以及选中月份，每个项目的账单明细；
每个项目的账单明细，可以看到当前项目的总费用，分析费用，存储费用和下载费用；分析费用分流程分析费用和个性分析费用；存储费用分计算存储和二级存储费用；
【优化】任务管理新增“运行时长”和“费用”2个字段
Genpilot
【新增】插件新增原生模型、时空知识库，增加每个插件的推荐问题
单击首页“推荐”按钮，可查看每个插件的推荐问题，单击插件名称可切换查看对应的推荐问题：
【新增】首页显示每日文献
单击首页“每日文献”，可查看昨天及今日的时空单细胞文献。若文献有对应的pdf文件，单击文献标题可进入文献速读：
【新增】首页新增使用指南入口
单击可查看Genpilot使用指南
【新增】首页问答显示插件名称
选择插件发送问题后，Genpilot返回的回答将显示所用插件名称：
【新增】首页问答联系上下文智能推荐问题
除原生模型外，Genpilot返回答案的同时，也将根据问题及回答推荐3个可能继续提问的问题，单击问题直接发送提问：
【新增】首页问答新增参考文档角标展示
除原生模型外，Genpilot返回的答案中，将显示所引用的参考文档角标，按与内容相关性排序:
【新增】首页问答支持对参考文档进行删除、恢复删除后重新回答
可选择一个参考文档进行删除，将重新生成回答。删除文档仅针对本次问题起效：
点击“已删资料”，可查看被删除的参考文档
选择参考文档，单击恢复，已删资料将重新应用生成回答：
【新增】新增文献助手应用，支持基于时空文献库的查询及问答
【新增】新增智能分析应用，支持基于时空工具库的生信分析工具推荐
可提问需进行的生信分析任务，Genpilot将基于时空工具库推荐生信分析工具，并提供工具说明及来源信息：
【新增】新增生物学解读应用，支持基于NCBI库的基因解读，及基于时空知识库的细胞注释
- 基因解读
可提问基因组学问题，Genpilot将基于NCBI库进行回答，并展示思考过程，也可收起思考过程：
收起思考过程：
- 细胞注释
输入基因列表，获取对应的细胞类型、物种、组织信息，并提供对用的文章和知识库来源供验证
【新增】新增文章撰写应用，支持文章润色、翻译、头脑风暴、查找文献、生成内容等撰写功能
支持文章基础编辑、智能编辑、预览下载等功能：
【优化】整体UI优化
整体优化UI界面及交互体验
【优化】优化插件名称及对应的输入框提示
对每个插件名称进行优化、规范，并加强提示：
【优化】文献上传增加每日限制
文献上传每个用户每天限5篇，每篇30页以内：
【优化】时空客服（原：时空知识问答）参考文档支持打开查看
优化时空客服文档来源，用户单击文档可打开新页面查看具体内容：
