v3.4.0 版本更新公告
流程分析
【新增】流程发布时多片区同步
该功能用于保证工作流发布公共库时,同步到各个片区的工作流是可用的,所以发布到公共库中的工作流会使用公共库中的镜像地址。
在发布工作流时,镜像与流程联动发布,您可以会遇到以下几种场景;
工作流中的镜像地址是公共库的链接地址,则成功发布;
工作流中的镜像地址为个人创建
如果是您本人创建的镜像,且镜像未发布过,则发布工作流时需要将镜像和工作流一同发布到公共库;
如果是您本人创建的镜像,镜像发布过,则可直接发布;如果在发布后私人镜像修改过,此时待发布的工作流所用的镜像已经与公共库中不一致了,镜像需要随着工作流更新发布一次。
注意:发布到公共库中的工作流不可使用他人的镜像地址。
【新增】工具订阅
面向工具开发者,该功能用于创建的工具设置订阅规则
创建工作流时,新增工具订阅规则设置

当前支持按次订阅收费,勾选“订阅付费”按钮后,为工具设置单价和折扣
注意:
订阅设置由权限控制
当勾选收费时,工作流默认隐藏WDL代码
面向分析人员,用户可以从公共库中订阅工作流,订阅之后将工具添加到项目中。
在项目中,分析人员每提交一次任务,将会扣取一次次数,如果任务运行失败,可对失败的任务重运行直到跑出结果。
当项目中订阅次数用完,将不可提交任务,可以点击【订阅】按钮进行续订。
注意:不可对一条失败的任务重复提起多次重运行,只有一次重运行可免次数。
【优化】任务投递后跳转交互
该功能优化了投递完任务的交互,可选择前往任务管理查看,或停留在流程分析模块

【优化】从公共库复制交互
该功能优化了从公共库添加工作流时的页面交互。

交互分析
高级分析
【新增】单细胞多文库整合
支持单个样本不同文库整合分析,手动定义样本名称,方便区分任务及结果,同时兼容10x,C4单细胞标准分析结果接入。

【新增】单细胞中英文版报告生成
支持单细胞高级分析产出中英文版报告

【优化】提交任务弹框优化
时空&单细胞高级分析提交任务确认框增加:高级分析结果存储时间提示,以便提醒用户及时下载和拷贝。
任务提交成功后,提示任务的结果生成的位置,支持用户跳转过去查看,也可继续留在界面进行后续分析。


【优化】流程投递增加默认参数
时空和单细胞高级分析每个步骤显示默认推荐值,用户也可手动更改调整参数

【优化】加载数据增加gef筛选
时空高级分析用户选择文件时,会自动筛选所有可以投递的gef文件,同时过滤掉其他文件夹,用户无需翻找数据,选择需要的文件即可投递分析。
如需要查看其他文件,也可以×掉左上角gef标签展示所有文件夹。


【优化】全流程投递按钮优化
全流程投递增加“下一步”按钮,方便用户点击全流程自动投递时逐个步骤确认参数,全流程最后一步确认完成后,会变成提交按钮,方可投递分析。
针对有物种信息选择的几个步骤:注释、互作和富集分析模块,取消物种默认值,用户投递时需手动选择分析所需物种,以避免报错。




【优化】IN新增算法选择
为避免细胞互作的warning情况,时空高级分析细胞互作的中计算每个cluster平均基因表达的算法选择。

【优化】加载数据界面&聚类&注释页面优化
加载数据界面新增任务投递操作指引。
聚类注释界面marker基因表格改为默认隐藏,可通过上拉按钮显示,方便更直观展示聚类图。



【优化】复制项目支持可视化
复制后的项目高级分析任务支持可视化跳转查看结果

任务管理
在线分析
【新增】新增在线管理任务日志,实时监控容器运行情况

流程分析
【新增】重运行可重新选择参数投递
该功能用于针对已生产的任务重新投递任务。

点击重新运行后,进入到流程分析的运行界面,可以修改参数重新提交任务。

【优化】详情页展示
该功能优化了任务的详情页展示,详情页由详情信息与运行日志组成。方便用户查看任务运行的情况
详情页显示分析状态、投递信息以及输入输出

新增任务状态显示,显示任务运行的步骤情况,
投递信息新增父任务ID,运行时长修改总耗时=结束时间-开始时间,新增分析时长,为真实分析所用时长。
输出新增【查看结果目录】,点击后新开页面进入数据管理,显示结果文件夹所在的目录、
文件新增操作【查看】按钮,支持在线预览文件,当前支持的类型有png、txt、json、pdf、html。
运行日志展示流程执行日志、工作流运行详情

工作流运行详情展示流程运行每个步骤的信息。
运行步骤可查看【sterr】【stout】【script】【中间结果文件】
【script】仅支持创建者查看
【中间结果文件】在中间文件保存的时间范围内可查看
中间结果文件保存遵循以下规则:
当任务完成,任务的最终结果文件保存到数据管理后,中间结果文件自动删除;
当任务失败或取消,中间结果文件默认保存三天,三天后删除。
计费管理
【新增】支持工具订阅计费,账单增加统计资源包费用
用户可在公共库付费订阅工具(如下图)。

结算确认支付后,该部分订阅费用将从对应项目的计费组中扣取,并计费组账单中:

【新增】支持用户查看、下载计费组费用账单明细
用户可在费用账单查看项目的账单明细。需留意:账单明细更新时间较账单汇总有0.5-1小时的延迟。

可下载该计费组下所有项目的账单明细。

【新增】支持计费组管理员查看、下载费用账单明细
计费组管理员可在后台管理端,查询并下载计费组账单明细。

【优化】支持计费组管理员查看计费组余额

公共库
【新增】公共项目新增社区属性

【新增】公共应用新增“付费”分类,支持工具订阅功能

选择需要订阅的工具,选择订阅的项目,并输入订阅次数,点击结算

确认订单信息,点击确认支付即可,系统将复制该流程到项目内,并扣除对应计费组的费用。

注意:同一项目内,同一订阅流程仅支持存在一份,不支持复制多个副本。