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时空分析工具

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概览 Stereo-seq Analysis Workflow StereoMap 演示数据

时空组学研究：从测序到可视化的全流程

该解决方案涵盖了空间组学数据的完整工作流，从原始读数与图像配准，到空间定位及结果可视化。

Stereo-seq Analysis Workflow

构建空间表达图谱

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从芯片测序到组织空间定位

SAW生信分析工具整合测序数据和配准图像，高分辨地量化组织区域上的特征信息，
输出精确的空间表达矩阵。

StereoMap

用于空间组学可视化与探索的交互式平台

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在组织空间中可视化并探索基因或蛋白的表达特征与分布

探索多个分子特征在空间上的共表达模式

在细胞bin及多尺度网格bin下进行空间聚类与形态学验证

根据组织形态手动注释空间区域

导出用于汇报与发表的高清图像

演示数据

大鼠脑

产品方案：时空转录组大尺寸芯片
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：ssDNA染色

小鼠肠

产品方案：时空转录组FFPE
试剂盒版本：Stereo-seq N FFPE V1.1
样本保存：福尔马林固定石蜡包埋
染色方案：ssDNA染色

小鼠胚胎

产品方案：时空转录组大尺寸芯片
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：H&E染色

时空转录组FF V1.3 兼容mIF

小鼠睾丸

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：DAPI+mIF染色

小鼠脾脏

产品方案：时空蛋白转录组Stereo-CITE
试剂盒版本：Stereo-CITE T FF V1.1
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：DAPI染色

小鼠脑

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：DAPI+mIF染色

小鼠卵巢

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：H&E染色

小鼠舌

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：H&E染色

小鼠脑

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：ssDNA染色

小鼠脑

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：H&E染色

小鼠眼球

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.3
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：H&E染色

小鼠脑

产品方案：时空转录组FFPE
试剂盒版本：Stereo-seq N FFPE V1.0
样本保存：福尔马林固定石蜡包埋
染色方案：H&E染色

小鼠肺

产品方案：时空转录组FFPE
试剂盒版本：Stereo-seq N FFPE V1.0
样本保存：福尔马林固定石蜡包埋
染色方案：H&E染色

小鼠脑

产品方案：时空转录组FFPE
试剂盒版本：Stereo-seq N FFPE V1.0
样本保存：福尔马林固定石蜡包埋
染色方案：ssDNA染色

小鼠脑

产品方案：时空转录组FFPE
试剂盒版本：Stereo-seq N FFPE V1.0
包埋方式：福尔马林固定石蜡包埋
染色方案：H&E染色

小鼠胸腺

产品方案：时空蛋白转录组Stereo-CITE
试剂盒版本：Stereo-CITE T FF V1.0
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：DAPI染色

大鼠脑

产品方案：时空转录组大尺寸芯片
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.2
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：DAPI染色

小鼠嗅球

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.2
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：DAPI染色

小鼠肾脏

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.2
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：H&E染色

小鼠脑

产品方案：时空转录组FF
试剂盒版本：Stereo-seq T FF V1.2
样本保存：新鲜冷冻
染色方案：ssDNA染色

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